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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004089`

染色体: Chr07 坐标: 52415747-52420614 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004089`
名称	SmilChr07G004089
描述	uncharacterized SmilChr07G004089
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52415747 - 52420614 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994760`
GeneID	`130994760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994760`
原始查询	`SmilChr07G004089`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase-like protein (PEARLI 4) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829663]; symbol=AT4G35110; hit=AT4G35110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	phospholipase-like protein (PEARLI 4) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829663]; symbol=AT4G35110; hit=AT4G35110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G35110` (AT4G35110) phospholipase-like protein (PEARLI 4) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829663] identity=25.9; qcov=0.411; evalue=5.17e-14; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05278 (PEARLI-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775803.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057775803.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775803.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775803.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52417273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:52417288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:52417501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:52418813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:52418920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:52418934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr7:52419080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:52419124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C6
`Chr7:52419398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775803.1

404 aa

202

404

PEARLI-4

PF05278 PEARLI-4 235-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775803.1`	Pfam	`PF05278`	PEARLI-4	Family	235	383	6.1e-21	75.8	Arabidopsis phospholipase-like protein (PEARLI 4)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919820.1
CGAGCAAAAATATTCGATTCATTTACAACCCTACTTCAAACCCCGCCAAATAAAGGGACACTTCGCCCGAGTGGCTGCAGAGGTGAAGTTGTGGGAGAATGTTTGGGTGGAGGTTTGCGCGAAGTGGCTTTCCGGGCATTCCGACTACATGCTCCAACAGAAGGCCCAAGTCATCTTCCAAGCTAGGAGCCTCACTTCTGGCCCCTTCAACTACTGGAATGCATGGAGGATGCTCCGAATCAACCGGAGGTTCAAGTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994760
ATGGAAAAGAATGAAAATGTCGATTTCGTCTTGCCCGATAGCTGGGCCGCCTCCACACCTCCCGGTTTCCCACCCCAATCGCTCAAAGCTCGCAGCTCCGCCGCCGCCGGATTATCAACAAATCCAAACCCCTCTTCTAAAGAAAACGAGCCAGTCCATGGACTAAATCAAACGCCGCGCCGCCGCACCTGTAGGAAGAGATCCCGCCCGCAATTCTACGCGCCTTCAGCTCCACCAAAACTGGCGGCGGCTGGACGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775803.1
MEKNENVDFVLPDSWAASTPPGFPPQSLKARSSAAAGLSTNPNPSSKENEPVHGLNQTPRRRTCRKRSRPQFYAPSAPPKLAAAGRRCRGRPPKSGFISRLAHLKTVTSDGNGVSPVSKDQSSLQVNDNQVVEHGSHPSPHSLVGLKTNTKKKTSESRMNQRTSFCAHDIEDILVDISLTEVPNERARGVGHNNQISEGIDSKIWQHVANALQYMTGNQTAVADAKVMPRSSGFNPSLVHTLEAINKKHGDITRGCLLES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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