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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004096`

染色体: Chr07 坐标: 52484160-52494721 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004096`
名称	SmilChr07G004096
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52484160 - 52494721 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994759`
GeneID	`130994759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994759`
原始查询	`SmilChr07G004096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=26; qcov=0.915; evalue=1.64e-34; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=26.5; qcov=0.703; evalue=1.13e-38; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994759

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775801.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775801.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775801.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775801.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52485263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C77,C87
`Chr7:52485264`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A11,B126,B98,C33,C62
`Chr7:52485264`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A11,B126,B98,C33,C62
`Chr7:52485269`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A18,A21,A3,A8,B102,B105,B108,B136,B16,B20,B27,B32,B37,B40,B65,B66,B74,B90,B91,B92,C18,C34,C4,C50,C53,C65,C72,C76,C79,D11,D4,D6
`Chr7:52485459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:52485467`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C79
`Chr7:52485467`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C79
`Chr7:52485507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D8
`Chr7:52485512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:52485550`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A3
`Chr7:52485550`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A3
`Chr7:52485562`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A16,A20,B107,B110,B111,B130,B131,B2,B23,B27,B48,B49,B55,B6,B62,B63,B72,B73,B78,B83,C18,C41,C56,C63,C67,C76,C9,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775801.1

681 aa

340

681

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 164-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775801.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	164	332	5.7e-27	95.1	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919818.1
ATTTAATTTGGTAGTTGAAAAACATTAAAAGCAAAGTTGATTTTGAAGCAACTCTCATAATTTTCAACTGGTTGATTGCTCAATCTTCATAATTAGAATCTTCGGTTGCTTTGTTTCTCGCTACTATTCTTACACACAATTGCCATAAAAATCATCAATAGATCGATTTTACCATTGCATTATATACACATCTTTTCAAATCATTTACTAAATTCTTGAATGTGGTTTTGAATGTTTCTGAAATTGTATCACAACCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994759
ATGGCGGCATATGGTGCGGCGATTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCATTTCCCACTCTCCACAAATCTTACAGCTTGTGTACGACCAGATGGATTACTTGCAGAGAGTTCTGCGGTTATTGGACAAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGGCGGAGGTGAATGCTTTGGATGAACTCATAAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATCTCTTACATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775801.1
MAAYGAAISLKNTIQRILQSSRISLISHSPQILQLVYDQMDYLQRVLRLLDKTSCSKIRAEVNALDELIKEAVWEFEDLLESHLLHQILPQLESERYNLSFSVDLQSLQHHVACFIEMVKMMEVEYFIEMENMPEEEGEPISSRIDSGGMIKSKMVMTIRLSDEFQKLIDYLLEGNNYYSIVGMAGVGKTTLAKHIFEDPSIRSHFEFRAWVKVGRKCEPNELLRCVLAQVDPNAYQMLAQGDDGEEEELVGLLKEKLLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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