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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004105`

染色体: Chr07 坐标: 52660621-52662133 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004105`
名称	SmilChr07G004105
描述	uncharacterized SmilChr07G004105
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52660621 - 52662133 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994384`
GeneID	`130994384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994384`
原始查询	`SmilChr07G004105`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775412.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057775412.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775412.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775412.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52660723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:52660806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B3
`Chr7:52660806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr7:52660874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C60
`Chr7:52661016`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr7:52661016`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr7:52661020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B12,B52,B55
`Chr7:52661056`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A20,A21,B11,B111,B118,B12,B139,B3,B52,B54,B55,C25,C4,C43,C52
`Chr7:52661066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B97,C74
`Chr7:52661315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B40,B73
`Chr7:52661315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B73
`Chr7:52661316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775412.1

203 aa

102

203

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 52-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775412.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	52	158	3.7e-08	34.0	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919429.1
ATGGAAGTTACATTGCGCAAAACAAACTCATCTTCAGGTTCATTGCTACATGAATTGAAAAATGTGCCCGATTGCATTCATTGTGGTGCAAGAGGATTTGAAAAATGTGTCCGATTGCATTCATTGTGGTGCAACACATCTTTCTCCAAAATTGATGAGAGTGCAATATGCAAAAAATGCAATGAAGAAGTTCTTGAGACGTCGCCCAGATACAGAATCACAATAAATGTTATACAAGGCGACTGCAATGCACGTATTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994384
ATGGAAGTTACATTGCGCAAAACAAACTCATCTTCAGGTTCATTGCTACATGAATTGAAAAATGTGCCCGATTGCATTCATTGTGGTGCAAGAGGATTTGAAAAATGTGTCCGATTGCATTCATTGTGGTGCAACACATCTTTCTCCAAAATTGATGAGAGTGCAATATGCAAAAAATGCAATGAAGAAGTTCTTGAGACGTCGCCCAGATACAGAATCACAATAAATGTTATACAAGGCGACTGCAATGCACGTATTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775412.1
MEVTLRKTNSSSGSLLHELKNVPDCIHCGARGFEKCVRLHSLWCNTSFSKIDESAICKKCNEEVLETSPRYRITINVIQGDCNARITLFGQVAEVYVGCSVDEYLSSIKEGETESTYYRRLSTQAYTEMRFMTMLKSIKFDQRGNLNIVANAIEKMEPMESIDVGDIEEEPTEMEEKKHSPEKSKKKIPSRKKKSTMELQPVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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