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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004133`

染色体: Chr07 坐标: 53050340-53052559 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004133`
名称	SmilChr07G004133
描述	uncharacterized SmilChr07G004133
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53050340 - 53052559 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994888`
GeneID	`130994888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994888`
原始查询	`SmilChr07G004133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03216 (Rhabdo_ncap_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775992.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775992.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775992.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775992.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53051396`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D4
`Chr7:53051396`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D4
`Chr7:53051415`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B111,C5
`Chr7:53051415`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B111,C5
`Chr7:53051439`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B7,C75
`Chr7:53051439`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B7,C75
`Chr7:53051451`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B111,B52,B7,B72,C21,C26,C5,C52,C75,C82
`Chr7:53051534`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C21
`Chr7:53051534`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C21
`Chr7:53051609`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B40,B52,B59,B82,C15,C21,C59,D7
`Chr7:53051652`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B40,C59
`Chr7:53051652`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B40,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775992.1

385 aa

192

385

Rhabdo_ncap_2

PF03216 Rhabdo_ncap_2 41-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775992.1`	Pfam	`PF03216`	Rhabdo_ncap_2	Family	41	327	9e-67	226.2	Rhabdovirus nucleoprotein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920009.1
GAATTCAAGGAGAGCACAATGAAGGAAGAAACCCCAAAATCTAAGGAAGCAAACACCTACAAAAGCACAAGTGAGACTACCGAATCTGCATCGGAGGACATACCGGATTTAAGTGACGAAGGAGTGTCTCACAATGATTTTAAGGATGGAGCTTGGTCTCAAAAAGATGCTCTCATATTAGAGACATTATCTGAAGACGCTATCATACGTTTGGGTAATGAACTCTTAACAAACTTAACCGCTGGGATATCGCAACGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994888
ATGAAGGAAGAAACCCCAAAATCTAAGGAAGCAAACACCTACAAAAGCACAAGTGAGACTACCGAATCTGCATCGGAGGACATACCGGATTTAAGTGACGAAGGAGTGTCTCACAATGATTTTAAGGATGGAGCTTGGTCTCAAAAAGATGCTCTCATATTAGAGACATTATCTGAAGACGCTATCATACGTTTGGGTAATGAACTCTTAACAAACTTAACCGCTGGGATATCGCAACGACATGTCGGTTCCATACTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775992.1
MKEETPKSKEANTYKSTSETTESASEDIPDLSDEGVSHNDFKDGAWSQKDALILETLSEDAIIRLGNELLTNLTAGISQRHVGSILLLAFHLHAPGIGNTERIVSVDKLARERDSELMSLENTVTYKPGKPCTVSEKGTKFEKARAYAFIAASMLKMFTRSSENYCRSWTHILNGHRKFYLIETPITAPKPLGKVLQQIRHHFSVSDIMKATLYRILYNMNEGGNITSVQKYLYDIHLSHTGMHIVPIAYNICLAMNVSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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