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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004140`

染色体: Chr07 坐标: 53178144-53180277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004140`
名称	SmilChr07G004140
描述	uncharacterized SmilChr07G004140
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53178144 - 53180277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994831`
GeneID	`130994831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994831`
原始查询	`SmilChr07G004140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007789]; symbol=AT1G51538; hit=AT1G51538; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007789]; symbol=AT1G51538; hit=AT1G51538; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G51538` (AT1G51538) Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007789] identity=27.6; qcov=0.303; evalue=6.91e-09; confidence=low
Rice	`Os03g0565300` - identity=25.4; qcov=0.311; evalue=1.51e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10536 (PMD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775895.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775895.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775895.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775895.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53178243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B81,C27
`Chr7:53178302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B8
`Chr7:53178302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:53178575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C23
`Chr7:53178773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:53178779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C23,C83
`Chr7:53178843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:53178876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:53179074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C43
`Chr7:53179202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:53179327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B112
`Chr7:53179327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775895.1

671 aa

336

671

PMD

PF10536 PMD 309-552 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775895.1`	Pfam	`PF10536`	PMD	Domain	309	552	3e-25	89.8	Plant mobile domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919912.1
GCGTTGCTTCCTTGCAGTGTCACGATGGTGGTCTTCAAAGATATTGTGGTCAAGGGTCAAGATTATTTGCTGATTTTGAGTGATGATGAGCAAGAGACGGAAATGGGCATGCATCTAAGAGTATTTCCGGCATTGATAGGCCACTATGTGAAACCTTGGCCCAAACTTTTGAATTCTCTATATCAGTCGGAATGGACCAGCGAGATCAGTTTGAACAAAGCGTCGAAGGCTCATACATTGCATCCGGCCCGTCCTTGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994831
ATGGTGGTCTTCAAAGATATTGTGGTCAAGGGTCAAGATTATTTGCTGATTTTGAGTGATGATGAGCAAGAGACGGAAATGGGCATGCATCTAAGAGTATTTCCGGCATTGATAGGCCACTATGTGAAACCTTGGCCCAAACTTTTGAATTCTCTATATCAGTCGGAATGGACCAGCGAGATCAGTTTGAACAAAGCGTCGAAGGCTCATACATTGCATCCGGCCCGTCCTTGGCAAAGCAAGGAATCCAATTTTCTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775895.1
MVVFKDIVVKGQDYLLILSDDEQETEMGMHLRVFPALIGHYVKPWPKLLNSLYQSEWTSEISLNKASKAHTLHPARPWQSKESNFLLTLRRRIIDKDAKWGRVTSFRGEFHFFEGYWEWTEDILSRCGNELRVVGIYDAVYASLFTYDCQPEMVKAFCEAWYPATNTILTSSGEMSISLWDLQYLSGLPCTGTLYDEVVPCAKEILGKDQFGNPFIPLSCRYLLSAYYSLKHRDGKDPKSSVSIDEWIKFWSKKASKYSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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