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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004153`

染色体: Chr07 坐标: 53388582-53389712 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004153`
名称	SmilChr07G004153
描述	uncharacterized SmilChr07G004153
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53388582 - 53389712 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994398`
GeneID	`130994398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994398`
原始查询	`SmilChr07G004153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25; qcov=0.67; evalue=1.26e-18; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=24.4; qcov=0.721; evalue=4.64e-14; confidence=weak
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994398

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775424.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775424.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775424.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775424.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53388637`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B108,B132,B49,B76,B78,B79,B91,C57
`Chr7:53388640`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B108,B132,B49,B76,B78,B79,B91,C57
`Chr7:53388643`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B108,B132,B76,B78,B79,B91,C2,C57
`Chr7:53388661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C55
`Chr7:53388693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C64
`Chr7:53388700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,C16,C79,C83,C84
`Chr7:53388732`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr7:53388732`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr7:53388763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B110,C20
`Chr7:53388764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr7:53388771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr7:53388780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C75,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775424.1

376 aa

188

376

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 1-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775424.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	1	224	5.7e-15	56.4	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919441.1
ATGTCCTACAATATTCGAGGCTTGGGGAGTGTGGCGAAGAAACGGGATGTACTGGATAATATTAGAATGCAGCGGGTTGATTTCTGCTTTCTCCAAGAAACTAAATTGGAGGTTTTTGAGGAGCACGTTTGCTCCGGTTGGTGGGGAAGACACAATTTTGATGTTGCGGTTCGGAATGCAGAGGGTAGAGCGGGCGGTATTCTGAGCGCTTGGAATACAGCTTCCTTCACGGCTTCAAGTAAATGGGATATTCCAGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994398
ATGTCCTACAATATTCGAGGCTTGGGGAGTGTGGCGAAGAAACGGGATGTACTGGATAATATTAGAATGCAGCGGGTTGATTTCTGCTTTCTCCAAGAAACTAAATTGGAGGTTTTTGAGGAGCACGTTTGCTCCGGTTGGTGGGGAAGACACAATTTTGATGTTGCGGTTCGGAATGCAGAGGGTAGAGCGGGCGGTATTCTGAGCGCTTGGAATACAGCTTCCTTCACGGCTTCAAGTAAATGGGATATTCCAGGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775424.1
MSYNIRGLGSVAKKRDVLDNIRMQRVDFCFLQETKLEVFEEHVCSGWWGRHNFDVAVRNAEGRAGGILSAWNTASFTASSKWDIPGAVVVNGFRQDDGRAFCLVNVYAPCDSSGKSELWDKLKLVADQNSERCVCFLGDFNAIRDESERVGRGEQFGRADMRRFDSFLRDCGLTEVRTQGRRFTWYQASGGCKTKLDRFFVNDTWLEAWPETVGRCLKRSVSDHCPILLSTKKVEWGPKPFRFVNAWTTHPEFKGLVRRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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