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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004168`

染色体: Chr07 坐标: 53586571-53590694 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004168`
名称	SmilChr07G004168
描述	uncharacterized protein At1g76660-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53586571 - 53590694 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994872`
GeneID	`130994872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994872`
原始查询	`SmilChr07G004168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835319]; symbol=AT5G52430; hit=AT5G52430; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835319]; symbol=AT5G52430; hit=AT5G52430; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G52430` (AT5G52430) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835319] identity=43.8; qcov=1.1; evalue=6.19e-99; confidence=medium
Rice	`Os02g0822000` (OJ1119_A01.13-1) - identity=45; qcov=1.03; evalue=3.42e-90; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30477 (At1g76660)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775965.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775965.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775965.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775965.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775965.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53586899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr7:53587005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C85
`Chr7:53587362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,D2,D6
`Chr7:53587410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B65,D2,D6
`Chr7:53587416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:53587578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B131,B2
`Chr7:53587623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B76,B88
`Chr7:53587680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B131,B2
`Chr7:53587844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:53587917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B8,C43,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775965.1

427 aa

214

427

At1g76660

PF30477 At1g76660 34-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775965.1`	Pfam	`PF30477`	At1g76660	Family	34	239	5.8e-52	178.2	At1g76660-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919982.1
ATCATCGTTAAATTAAACTAATCGCTTTTCAGTCACTGCCGTGTTTGACCTCTGAATCACTATATATACACACATCATATATATATATATATATATATATATATGTATGTGTGTGTGTGCATTTTCTTCACCGCGTCTACATACAAATACAATTCGCTGCTGCGTCTGGGCACCGTCTTTCCATTTCCGTTTCTCGCAAATCGAATTTGGCGAACTGTAACATTTGATTTCACGTTTTGTTGCGTGATTTTGCCTCTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994872
ATGAGAAGAGGAGCGAATGGACCCGACGCGATGGAGACCATTAACGCCGCCGCCTCGGCGATCGCATCTGGGGAGACGCGCGGCGATCATGCTTCGAGTCAGAAAAGAAGGTGGGGAAGCTTCTGGAGCCTTTACTGGTGTTTCGGATCACCCAAGAATAAACGAATCGGGCATGCCATTCTTGTTCCTGAAAGTAGTGCCGCAGGGGCTGATTCCACCACAGCTGAACATTCATCCCAAGCACCTTCGATAGTATTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775965.1
MRRGANGPDAMETINAAASAIASGETRGDHASSQKRRWGSFWSLYWCFGSPKNKRIGHAILVPESSAAGADSTTAEHSSQAPSIVFPFVAPPSSPASFLPSETPSATQSPSGIFSMTSVSANMYSPGGPASMFAIGPYAHETQLVSPPVFSTFTTEPSTAPYTPPPESVHMTTPSSPEVPFARLLEPNLQNGQRFPFSQYEFQSYQLQPGSPVSHLISPSSGISGSGTSSPFPDREFAAAGHPFFLEFRTGNPPKLLELD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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