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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G004169

染色体: Chr07 坐标: 53606109-53608859 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G004169
名称SmilChr07G004169
描述cyclin-J18-like
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向53606109 - 53608859 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130994963
GeneID130994963
locus_tag-
NCBI NameLOC130994963
原始查询SmilChr07G004169

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述cyclin-J18-like
产物cyclin-J18-like
ArabidopsisAT2G01905 (CYCJ18)
cyclin J18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768365]
identity=51.7; qcov=0.989; evalue=9.59e-27; confidence=medium
Rice-
-
GO-
KEGG-
PfamPF00134 (Cyclin_N)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130994963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 0.80000 XP_057776159.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057776161.1
3 Cytosol 细胞质基质 0.20000 XP_057776159.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057776159.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057776159.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776159.1
132 aa
N
1
66
132
Cyclin_N
C
PF00134 Cyclin_N 8-72 aa
XP_057776160.1
132 aa
N
1
66
132
Cyclin_N
C
PF00134 Cyclin_N 8-72 aa
XP_057776162.1
90 aa
N
1
45
90
Cyclin_N
C
PF00134 Cyclin_N 8-72 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057776159.1 Pfam PF00134 Cyclin_N Domain 8 72 1.1e-06 29.0 Cyclin, N-terminal domain
XP_057776160.1 Pfam PF00134 Cyclin_N Domain 8 72 1.1e-06 29.0 Cyclin, N-terminal domain
XP_057776162.1 Pfam PF00134 Cyclin_N Domain 8 72 6.1e-07 29.9 Cyclin, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057920176.1
CATAACGGTTTTTTTTAAAAACCGTTATGTATGAGCGCATTTTTTGAAAAGATAACGGTTTTGACAAAAAACCGTTATCTATGTACTGTTGTCCATGGAAATAGATAACGGTTTAAGTTAATCCGTTATGTTTATGTGTTATCTATTAGTTTCATACATAACGGTACTACAAAACCGTTAAACCGACCGTTATCTATGAGCATTTTTTTTATTTTAAAATTTAACTTAATCTAATTCCCCCAAGCCACCAAACACTAACA...
XM_057920178.1
ATAACGGTTTTTTTTAAAAACCGTTATGTATGAGCGCATTTTTTGAAAAGATAACGGTTTTGACAAAAAACCGTTATCTATGTACTGTTGTCCATGGAAATAGATAACGGTTTAAGTTAATCCGTTATGTTTATGTGTTATCTATTAGTTTCATACATAACGGTACTACAAAACCGTTAAACCGACCGTTATCTATGAGCATTTTTTTTATTTTAAAATTTAACTTAATCTAATTCCCCCAAGCCACCAAACACTAACAC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
LOC130994963
ATGAAAAACTGGCTTCTGCATCCGATTGGAGAATGTAACTTGCAGCTATTTGCTCTTGTTTCATTATGGATATCAAGCAAAATACATGATTCACCTTCTCTGTCTGTTAAAAATTTCAAATCCTTGGGAGACAACTTTATCAAGGAGCAACATTTCACCATGGGGGATATTTTGGAAGCTGAGATAGTGCTAATGCAGGTTCTGCAATTTGGGATTGGCATGTCGAAAATTGCTTTTGCTTCAGTTGAAGAGCTTCTTGT...
LOC130994963
ATGAAAAACTGGCTTCTGCATCCGATTGGAGAATGTAACTTGCAGCTATTTGCTCTTGTTTCATTATGGATATCAAGCAAAATACATGATTCACCTTCTCTGTCTGTTAAAAATTTCAAATCCTTGGGAGACAACTTTATCAAGGAGCAACATTTCACCATGGGGGATATTTTGGAAGCTGTTCTGCAATTTGGGATTGGCATGTCGAAAATTGCTTTTGCTTCAGTTGAAGAGCTTCTTGTTCAATTCAAGGCAGTTGC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057776159.1
MKNWLLHPIGECNLQLFALVSLWISSKIHDSPSLSVKNFKSLGDNFIKEQHFTMGDILEAEIVLMQVLQFGIGMSKIAFASVEELLVQFKAVAQVGEHVKFEACIDVMDLLYENEEYCCRIQNHYLCSYRKI
XP_057776160.1
MKNWLLHPIGECNLQLFALVSLWISSKIHDSPSLSVKNFKSLGDNFIKEQHFTMGDILEAEIVLMQVLQFGIGMSKIAFASVEELLVQFKAVAQVGEHVKFEACIDVMDLLYENEEYCCRIQNHYLCSYRKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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