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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004183`

染色体: Chr07 坐标: 53816357-53819089 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004183`
名称	SmilChr07G004183
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53816357 - 53819089 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994409`
GeneID	`130994409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994409`
原始查询	`SmilChr07G004183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=30.8; qcov=0.57; evalue=3.15e-57; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=30.5; qcov=0.548; evalue=3.78e-64; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775435.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775435.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775435.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775435.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775435.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53816399`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A22,B112,B121,B25,B40,B47,B56,B61,B66,B76,B8,B81,B88,B91,B96,C52,C77,C8,C80,C9,D3
`Chr7:53816402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C22,D1
`Chr7:53816439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:53816459`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B101
`Chr7:53816459`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B101
`Chr7:53816482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C30,C44,C83
`Chr7:53816489`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B101
`Chr7:53816489`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B101
`Chr7:53816490`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B101
`Chr7:53816490`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B101
`Chr7:53816498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:53816500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775435.1

910 aa

455

910

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 191-351 aa PF23559 WHD_DRP 444-507 aa PF23598 LRR_14 585-853 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775435.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	191	351	6.9e-43	146.9	NB-ARC domain
`XP_057775435.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	444	507	2.2e-16	60.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057775435.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	585	853	1.7e-13	50.8	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919452.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTCTCTTGAACAATATTCAGCAGATGATGACCCATCCTAACCTTTCCACTTCTTTCCACAACTATCAGATCCATTCCCTCGAGAAGAAGGCTGCTTTGTTGCTCCATTTCATAGAGACCTTTAATTATGGTGGACTTAGCCAAGAAGCACAACATCTCGAAAGCCTAATCACATCTGCTGCTCATACAGCTGAGGATATGATTGAATCACACATCGTCAATCAACTCCTTCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994409
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTCTCTTGAACAATATTCAGCAGATGATGACCCATCCTAACCTTTCCACTTCTTTCCACAACTATCAGATCCATTCCCTCGAGAAGAAGGCTGCTTTGTTGCTCCATTTCATAGAGACCTTTAATTATGGTGGACTTAGCCAAGAAGCACAACATCTCGAAAGCCTAATCACATCTGCTGCTCATACAGCTGAGGATATGATTGAATCACACATCGTCAATCAACTCCTTCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775435.1
MAAYAALVSLLNNIQQMMTHPNLSTSFHNYQIHSLEKKAALLLHFIETFNYGGLSQEAQHLESLITSAAHTAEDMIESHIVNQLLPLSADDREADFSFSLYLRKKGEIEDQFHSGSNQAIQEPAPYVAGDGCLEYLRQIIEDMDAIIKKANELNEIHRLREDQPPTPSTPKYAQTREESGMVGFGDELIQLLDELTGQRSNLHIISIIGMGGMGKTTLAKNIYAHQLIIERFDIRAWATVSHQYNAEQILQQLLSDKDNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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