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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004187`

染色体: Chr07 坐标: 53897442-53903212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004187`
名称	SmilChr07G004187
描述	beta-adaptin-like protein A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53897442 - 53903212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994814`
GeneID	`130994814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994814`
原始查询	`SmilChr07G004187`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-adaptin-like protein A
产物	beta-adaptin-like protein A
Arabidopsis	`AT5G11490` (AT5G11490) adaptin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831021] identity=78; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0355600` - identity=35.1; qcov=0.723; evalue=5.53e-105; confidence=medium
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0030117 (membrane coat); GO:0030131 (clathrin adaptor complex); GO:0030276 (clathrin binding)
KEGG	-
Pfam	PF01602 (Adaptin_N); PF09066 (B2-adapt-app_C); PF12717 (Cnd1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057775867.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057775867.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057775867.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057775867.1`
5	Endosome	内体	0.60000	`XP_057775867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53897711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:53898386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B67,C37,D7
`Chr7:53898591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:53899218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,C19
`Chr7:53899248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B61,C17,C63
`Chr7:53900114`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	53	A11,A15,A16,A19,A25,A4,B118,B119,B120,B123,B125,B133,B135,B138,B18,B19,B21,B27,B3,B30,B32,B33,B47,B51,B54,B56,B57,B6,B60,B63,B68,B7,B70,B71,B73,B84,B96,B98,C17,C23,C35,C40,C41,C54,C56,C57,C62,C72,C80,C86,C87,D1,D11
`Chr7:53900700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B55,C32,C68
`Chr7:53901877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:53901952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B61,C17,C63
`Chr7:53902130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B59
`Chr7:53903014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B79
`Chr7:53903019`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775867.1

840 aa

420

840

Adaptin_N

Cnd1

B2-adapt-app_C

PF01602 Adaptin_N 37-551 aa PF12717 Cnd1 115-287 aa PF09066 B2-adapt-app_C 723-834 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775867.1`	Pfam	`PF01602`	Adaptin_N	Repeat	37	551	1.9e-93	314.6	Adaptin N terminal region
`XP_057775867.1`	Pfam	`PF12717`	Cnd1	Repeat	115	287	8e-42	143.7	non-SMC mitotic condensation complex subunit 1
`XP_057775867.1`	Pfam	`PF09066`	B2-adapt-app_C	Domain	723	834	3.8e-24	85.6	Beta2-adaptin appendage, C-terminal sub-domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919884.1
GAAATAATAAGGCATTGTTCTAAAAAAAAATGCATTGCCCGGAAAAAAAATAAGTCAAAAAACACAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGTGACAAAAATATCATCGATCAAAATCTAAATTGTCTTTCCATGTCATTTTAACTCATCAAGATCTAGTTTTCTTTTTCACTCAAAATCATAGTTGTAGTGTTGTCCGAATCTCAGAATAGGGTGAATTGAGGCGTGAATTTGAAGATATCAGAATCAGCTATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994814
ATGGCACCTCCAGCTCAATCTCATCGATCCCCTTCTCCTTCTCAGCCCTCTGGGAAAGGAGAGGTTTCTGATCTTAAAACGCAGCTACGGCAGCTGGCAGGTAGCCGAGCTCCTGGAACTGATGATACAAAGAGGGAGTTGTTCAAGAAGGTTATATCTTACATGACTATTGGGATTGATGTATCTTCGGTTTTTAGTGAAATGGTGATGTGTTCGGCTACCTCAGACATCGTGCTAAAGAAGATGTGTTATCTGTATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775867.1
MAPPAQSHRSPSPSQPSGKGEVSDLKTQLRQLAGSRAPGTDDTKRELFKKVISYMTIGIDVSSVFSEMVMCSATSDIVLKKMCYLYVGNYAKHNPDLALLTINFLQRDCKDEDPMIRGLALRSLCSLGVANLVEYLVGPLSNGLKDGNSYVRMVAAVGVLKLYHLSASTCLDADFPPLLKQLMLKDKDAQVVANCLTSLQEIWSLEASTSEEAARERETLLSKPVVYYFLNRMKEFSEWAQCIVLELVSKYVPMDSEEIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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