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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004191`

染色体: Chr07 坐标: 53930623-53936857 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004191`
名称	SmilChr07G004191
描述	protein EMBRYONIC FLOWER 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53930623 - 53936857 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994793`
GeneID	`130994793`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994793`
原始查询	`SmilChr07G004191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EMBRYONIC FLOWER 1
产物	protein EMBRYONIC FLOWER 1
Arabidopsis	`AT5G11530` (EMF1) embryonic flower 1 (EMF1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831025] identity=50; qcov=0.07; evalue=1.14e-14; confidence=weak
Rice	`Os01g0229300` (CCP1) - identity=43.1; qcov=0.06; evalue=5.79e-07; confidence=weak
GO	GO:0009910 (negative regulation of flower development); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF28218 (EMF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994793

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775835.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775835.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775835.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775835.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53933055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D6
`Chr7:53933259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A8,B140
`Chr7:53934032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr7:53934137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B31,B4
`Chr7:53934634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B128,B135,C3
`Chr7:53935181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:53935235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:53935376`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	39	A25,A4,B101,B104,B108,B110,B117,B133,B14,B19,B24,B29,B32,B33,B34,B36,B50,B51,B52,B53,B54,B59,B77,B83,B87,B9,C15,C22,C29,C38,C59,C60,C74,C87,D10,D11,D4,D5,D6
`Chr7:53935731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B135,B140,C3
`Chr7:53936367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C39
`Chr7:53936418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B135,B99,C3,C39
`Chr7:53936431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775835.1

1082 aa

541

1082

EMF1

PF28218 EMF1 27-1067 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775835.1`	Pfam	`PF28218`	EMF1	Family	27	1067	4.2e-190	635.8	Embryonic flower 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919852.1
ACATTAAAAATTTGCGCACTCTCTCTCTCTCTCTCTAACCTCCTTTGTCTTCATTTTATCTCTATCTATCTCTCTCTAACTTTCTCTCTCTCTGTAAAAATAAAAACATTTCCTCCGAATTTTTTCAGACCTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAGAAACTCGAACGAGCACTCCTCCATTTCTTTCCAAGTCCAATCCGCGGGGGGCTCCCGCCGAATCGCTTCGAGAAAATCATAGAGATGAAATCGCCAGCTCCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994793
ATGGATAAGAGTATTGTGGCTGTGGAAGAAAGTCTGTGGAGAAATGATTCTCCTGTTTCTGCCTCAAAGTCTTTAGGATCACTCGTTCAGATTAACTCTATAGCTATAGACCTCAGTTGTGCCATGGAAGAGATTGAGTCACCGTTGCACGAGCATTTTTCAATACGTGGCTTTGTTGCTGGAATGCGGAAAAAAGACTCGAAGACGTGTTTGCCCTTTTCTTCACAAGGTGTAAATGATGATTTGGTCGATAATCTACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775835.1
MDKSIVAVEESLWRNDSPVSASKSLGSLVQINSIAIDLSCAMEEIESPLHEHFSIRGFVAGMRKKDSKTCLPFSSQGVNDDLVDNLPPLSVPKFRWWQCSTCVPDFAAESTGLEIVLADRSDAGTSSCQHFDREKEVLFSHSRRSIGDGHVLRESIDGEDNDPSNNMKNGDPQCEDHKATTSSKDKTDVRNDQCETSYAHITKANPVQVVERNDYNADVSDVRIAENASVGFDEPDDISFASDAAGCALSRRRKRKLRSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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