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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004193`

染色体: Chr07 坐标: 53969691-53976298 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004193`
名称	SmilChr07G004193
描述	bark storage protein A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53969691 - 53976298 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994908`
GeneID	`130994908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994908`
原始查询	`SmilChr07G004193`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bark storage protein A
产物	bark storage protein A
Arabidopsis	`AT4G28940` (AT4G28940) Phosphorylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829015] identity=61.4; qcov=0.971; evalue=2.6e-148; confidence=high
Rice	`Os05g0228000` - identity=59.3; qcov=0.922; evalue=1.21e-125; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0009116 (nucleoside metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01048 (PNP_UDP_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057776025.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057776025.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776025.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776025.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53972125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C34
`Chr7:53972158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:53974809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B119
`Chr7:53974847`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr7:53974847`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr7:53974892`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B10,B107,B23,B30,B48,B7
`Chr7:53974910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:53976057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B109,B59,B87,C86
`Chr7:53976108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B109,B59,B87,C86
`Chr7:53976123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776025.1

344 aa

172

344

PNP_UDP_1

PF01048 PNP_UDP_1 42-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776025.1`	Pfam	`PF01048`	PNP_UDP_1	Domain	42	334	2.3e-31	109.7	Phosphorylase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920042.1
TTTTTTTCCATTTATTTAAAATATCACAAATTCCTAACCACGTGAATCATGGCATATACTTCCCCTTCGATTATCATCATTTTTTGTAGTAGTTGAAAATCATTGAGCCTCTATAAATGCTGCTCCCTTCTCTCCCCAACTTTGCTCACTCTCACCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAATTAAGATGAAATTTGTAAGGTTTGTTGTGTTGTTAGTTGGTTTGAGTTTGTTGGTAGTGAACGAAGCTGCAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994908
ATGAAATTTGTAAGGTTTGTTGTGTTGTTAGTTGGTTTGAGTTTGTTGGTAGTGAACGAAGCTGCAATCCCTACAAAAACACTGATACAGATCAATAAGGCCAACAGAAATGGGCCTTATTTAGGATTGGTAATTCCAAACCAGTTTGAGCTCAATCCTCTTCTTCAACACCCTAGCTATGTACCCTCTAATCTCACCATCGACGTCTCAGGAAGGAGATTTAGATTTGGAACTGTTGCTGGAGAAAAGGCCATATTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776025.1
MKFVRFVVLLVGLSLLVVNEAAIPTKTLIQINKANRNGPYLGLVIPNQFELNPLLQHPSYVPSNLTIDVSGRRFRFGTVAGEKAILVMTGLAMVNSGITTQLLVTLFNLKGVIHYGIAGNADPSLHIGDVAIPQYWSHSALWNWQRYGDGPENSLALEGGGDYTREIGFIKFANYSTKASDNILNNVWYQPEEIFPIDGTPEEREHVFWVPVDPHYYSLAQKLEESMTLENCLNATLCLTYAPKITRVARGTSASIYVDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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