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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004195`

染色体: Chr07 坐标: 54008162-54008986 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004195`
名称	SmilChr07G004195
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54008162 - 54008986 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994410`
GeneID	`130994410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994410`
原始查询	`SmilChr07G004195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.1; qcov=0.81; evalue=4.08e-34; confidence=low
Rice	`Os03g0843700` (OSJNBa0032G11.9) - identity=30.5; qcov=0.777; evalue=1.65e-26; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775436.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775436.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775436.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775436.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775436.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54008164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr7:54008217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B2,C23
`Chr7:54008241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B18,C43
`Chr7:54008241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C43
`Chr7:54008262`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	104	A1,A10,A11,A13,A16,A19,A21,A4,A6,A7,A8,B100,B101,B102,B105,B109,B110,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B126,B127,B129,B131,B132,B137,B138,B14,B140,B17,B19,B20,B21,B29,B31,B33,B36,B38,B39,B4,B40,B43,B46,B51,B53,B54,B55,B6,B66,B67,B68,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B79,B8,B81,B87,B89,B95,C10,C11,C16,C17,C18,C20,C22,C23,C28,C34,C35,C37,C39,C4,C40,C44,C48,C52,C54,C55,C56,C58,C61,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C74,C75,C81,C84,C85,D5,D6,D7,D8
`Chr7:54008263`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	101	A1,A10,A11,A13,A16,A19,A21,A4,A6,A7,A8,B100,B101,B102,B105,B109,B110,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B126,B127,B129,B131,B132,B137,B138,B14,B140,B17,B19,B21,B29,B31,B33,B36,B38,B39,B4,B40,B43,B46,B51,B53,B54,B55,B6,B66,B67,B68,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B79,B8,B81,B87,B89,B95,C10,C11,C16,C17,C18,C20,C22,C23,C34,C35,C37,C39,C4,C40,C44,C48,C52,C54,C55,C56,C58,C61,C64,C65,C67,C69,C7,C74,C75,C81,C84,C85,D5,D6,D7,D8
`Chr7:54008281`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A4,A5,B109,B139,B45,B70,B92,C12,D10,D6
`Chr7:54008299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:54008309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A11,A20,A3,B1,B107,B140,B19,B27,B4,B65,B94,C53,C59,C6,C64,C80,C81,C82,D6
`Chr7:54008355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B25,C84
`Chr7:54008355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C84
`Chr7:54008373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919453.1
ATGATGAAGGTGGCACAAAAACTACCCATATCTTTGAGAGAGAATGCTGATCTGACGAGCAGATTATACGAAGTGGCGTGGTCAGAGCTTTATGAACCTAAAGAGTTTGGGGAGAAGTGGTTTGAGGTTATTAATGAGTATGGACTACAAGATCATTCGTGGTTCTCAGATATGTTTGCCAAAAGGACATTTTGGATCCCTGCGTTTTTTCGCGACTTCAGTATGAGTGGGTTGTTTAAAACAACCTCCATGTCGGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994410
ATGATGAAGGTGGCACAAAAACTACCCATATCTTTGAGAGAGAATGCTGATCTGACGAGCAGATTATACGAAGTGGCGTGGTCAGAGCTTTATGAACCTAAAGAGTTTGGGGAGAAGTGGTTTGAGGTTATTAATGAGTATGGACTACAAGATCATTCGTGGTTCTCAGATATGTTTGCCAAAAGGACATTTTGGATCCCTGCGTTTTTTCGCGACTTCAGTATGAGTGGGTTGTTTAAAACAACCTCCATGTCGGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775436.1
MMKVAQKLPISLRENADLTSRLYEVAWSELYEPKEFGEKWFEVINEYGLQDHSWFSDMFAKRTFWIPAFFRDFSMSGLFKTTSMSESENSFFRKYLNPNSNLASFYIYYESAMQSQRHSYKQLCMIDQTTTPHLMSNNPIEQHASDIYTKKIFLEVQVEIIEALNRCCIKSMDTGHAEHKYFVDRSSGVFFVAHNTVDDTIVCSCKKFVKVGLVCRHMFVVMHNIGLKSIPQKYIVGRWLKDAGASVITSDGRKAQNKPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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