当前解析结果
SmilChr07G004213| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004213 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004213 |
| 描述 | protein NONRESPONDING TO OXYLIPINS 2, mitochondrial |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 54321110 - 54323657 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994956 |
|---|---|
| GeneID | 130994956 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994956 |
| 原始查询 | SmilChr07G004213 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein NONRESPONDING TO OXYLIPINS 2, mitochondrial |
| 产物 | protein NONRESPONDING TO OXYLIPINS 2%2C mitochondrial |
| Arabidopsis | AT5G11630 (NOXY2)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831035] identity=58.2; qcov=1.03; evalue=2.76e-26; confidence=medium |
| Rice | Os02g0230000- identity=39.8; qcov=0.943; evalue=1.65e-07; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994956 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057776150.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057776151.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057776149.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776149.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776149.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:54321153 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B114,B17,B73,C30 |
Chr7:54321153 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B114,B17,B73,C30 |
Chr7:54321154 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | B113,B16,B23,B48,B56,B6,B7,B76,C18,C28,C53,C63,C67,D2 |
Chr7:54321195 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B118,C11,C19,C69 |
Chr7:54321202 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B18 |
Chr7:54321217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr7:54321364 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:54321841 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。