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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004226`

染色体: Chr07 坐标: 54490838-54493354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004226`
名称	SmilChr07G004226
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54490838 - 54493354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994419`
GeneID	`130994419`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994419`
原始查询	`SmilChr07G004226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
Arabidopsis	`AT1G58410` (AT1G58410) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842210] identity=23.6; qcov=0.99; evalue=1.11e-34; confidence=weak
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=27.9; qcov=0.763; evalue=2.37e-41; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994419

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057775446.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775446.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775446.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775446.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54490842`	`T`	`TC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B13
`Chr7:54490842`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr7:54490851`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A10,A13,B100,B106,B128,B39,B49,B50,B78,B91,B92,C32,C44,C66,C77,C78,D8
`Chr7:54490867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B128,C45
`Chr7:54490891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C23
`Chr7:54490892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B28,C57,D2
`Chr7:54490909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,B140,C14,C34
`Chr7:54490919`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B131,B132,B90,B92
`Chr7:54490919`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B131,B132,B90,B92
`Chr7:54490927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,B140,C14,C34
`Chr7:54490937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B132,B90
`Chr7:54490950`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C69,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775446.1

838 aa

419

838

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 212-372 aa PF23559 WHD_DRP 391-455 aa PF23598 LRR_14 523-789 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775446.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	212	372	4.7e-42	144.2	NB-ARC domain
`XP_057775446.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	391	455	1.7e-18	67.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057775446.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	523	789	2e-12	47.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919463.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTCTCTTGAACACCATTCAGCAGATGATGACCCATCCTACCCTTTCCACTTCTTTCCACAACATTCAGATCCAATCTCTTCAGGAGAAGGCTGCTTTGTTGCTTGATTTCATTGAGACCTATAACTATGTTGGTGGAGTTAGCCAAGAAGTACAAGATCTAGAAAGCCTAATCGCATCTGCTGCTCATACAGCTGAGGATATGATTGAATCACACATCGTCAATCAACTCCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994419
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTCTCTTGAACACCATTCAGCAGATGATGACCCATCCTACCCTTTCCACTTCTTTCCACAACATTCAGATCCAATCTCTTCAGGAGAAGGCTGCTTTGTTGCTTGATTTCATTGAGACCTATAACTATGTTGGTGGAGTTAGCCAAGAAGTACAAGATCTAGAAAGCCTAATCGCATCTGCTGCTCATACAGCTGAGGATATGATTGAATCACACATCGTCAATCAACTCCTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775446.1
MAAYAALVSLLNTIQQMMTHPTLSTSFHNIQIQSLQEKAALLLDFIETYNYVGGVSQEVQDLESLIASAAHTAEDMIESHIVNQLLPLSAHDREAAFSVSLYLQNKMAIEKKITQVAGDGWWINFMQIIKNQLERKKWQLKRKMHQANVSCLDYLPQIIEDMNAIIKKANKLKEKQRLREDQPPTHSTPPLSLTQTREESAMVGFGDELIQLLDELTGHRSNLHIISIVGMGGMGKTTLAKNIYANQLIIEHFDIRAWAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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