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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004231`

染色体: Chr07 坐标: 54592344-54593240 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004231`
名称	SmilChr07G004231
描述	probable thionin-2.4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54592344 - 54593240 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994965`
GeneID	`130994965`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994965`
原始查询	`SmilChr07G004231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable thionin-2.4
产物	probable thionin-2.4
Arabidopsis	`AT1G66100` (AT1G66100) Plant thionin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842924] identity=55; qcov=1.05; evalue=7.57e-41; confidence=medium
Rice	`Os06g0514100` (Osthi7) - identity=49.6; qcov=1.02; evalue=3.36e-28; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00321 (Thionin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994965

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057776165.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776165.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776165.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776165.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54592491`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C34
`Chr7:54592491`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C34
`Chr7:54592507`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A15,A24,A9,B104,B115,B120,B135,B17,B20,B22,B38,B39,B40,B5,B64,B66,B68,B69,B72,B77,B89,B94,B98,C17,C19,C21,C22,C25,C28,C31,C33,C36,C5,C53,C60,C61,C67,C69,C77,C84,D3,D5,D8
`Chr7:54592508`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A15,A24,A9,B104,B115,B120,B135,B17,B20,B22,B37,B38,B39,B40,B5,B64,B66,B68,B69,B72,B77,B89,B94,B98,C17,C19,C22,C25,C28,C33,C36,C5,C53,C60,C61,C67,C69,C77,D3,D5,D8
`Chr7:54592512`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A13,A4,B102,B113,B118,B134,B14,B32,B33,B45,B50,B66,B73,B77,B83,C26,C29,C50,C74,C81,C9,D11,D4,D5
`Chr7:54592516`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A10,A13,A4,B102,B108,B113,B118,B134,B14,B32,B33,B45,B50,B66,B73,B77,B83,C26,C29,C50,C74,C81,C9,D11,D4,D5
`Chr7:54592527`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	124	A10,A11,A15,A2,A20,A22,A23,A3,A5,A6,A7,A8,B10,B104,B105,B107,B108,B11,B110,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B127,B13,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B22,B23,B26,B27,B28,B3,B34,B35,B39,B40,B41,B42,B44,B45,B5,B55,B56,B58,B6,B60,B62,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B77,B80,B81,B83,B85,B88,B90,B92,B94,B97,B98,B99,C1,C11,C14,C15,C17,C18,C20,C24,C25,C3,C32,C36,C37,C38,C4,C42,C43,C44,C48,C5,C50,C53,C56,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C72,C74,C75,C76,C80,C87,C9,D1,D6,D7,D8
`Chr7:54592529`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	138	A1,A10,A11,A15,A2,A20,A22,A23,A3,A5,A6,A7,A8,B10,B102,B104,B105,B107,B108,B11,B110,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B127,B13,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B22,B23,B26,B27,B28,B3,B31,B34,B35,B39,B40,B41,B42,B44,B45,B5,B55,B56,B58,B6,B60,B62,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B77,B79,B80,B81,B83,B85,B88,B90,B92,B94,B97,B98,B99,C1,C11,C14,C15,C16,C17,C20,C21,C22,C24,C25,C3,C32,C33,C36,C37,C38,C4,C42,C43,C44,C45,C48,C5,C50,C53,C56,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C72,C74,C75,C76,C78,C80,C84,C85,C87,C9,D1,D6,D7,D8
`Chr7:54592559`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B49,B65,B87
`Chr7:54592559`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B49,B65,B87
`Chr7:54592570`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	8	A1,B107,B76,C21,C3,C84,C85,C86
`Chr7:54592574`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	75	A1,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A5,A6,A8,B10,B100,B107,B113,B12,B125,B13,B135,B137,B15,B2,B21,B23,B28,B3,B31,B35,B37,B4,B41,B54,B58,B62,B67,B71,B72,B74,B76,B8,B90,B92,B94,B99,C11,C14,C17,C18,C20,C24,C27,C3,C35,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C47,C5,C50,C54,C56,C62,C63,C69,C72,C75,C80,C82,C84,C85,C86,C87,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776165.1

125 aa

125

Thionin

PF00321 Thionin 30-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776165.1`	Pfam	`PF00321`	Thionin	Domain	30	67	1e-09	39.5	Plant thionin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920182.1
ACACCTAGTATTTAAGCTGGCTAATTTCATCAATATATACAAACTTGTATTACTTCTGTATATTTTGTAATCAAAAGAGAGAAGATGATATCCATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGCTGAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAGCAACGAGTTGTTGCCCAAACGTCACTGCCAGAAATGCCTATAATGTCTGTCCTTGTGCAAACTACAGTGGATGCAAACTTATTAATGGGGGTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994965
ATGATATCCATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGCTGAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAGCAACGAGTTGTTGCCCAAACGTCACTGCCAGAAATGCCTATAATGTCTGTCCTTGTGCAAACTACAGTGGATGCAAACTTATTAATGGGGGTACATGTCCCACTGGTTGGACTAACGATATTCTCGAAAACACTGTCGATGAATTCTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCCGTTTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776165.1
MISMEAKSLIMSALLLSLVLGQIQVEAATSCCPNVTARNAYNVCRXCANYSGCKLINGGTCPTGWTNDILENTVDEFCKLGCASSVCAAITTLQNSDASEVVNGAAEKCSQACSAFCTKASVSAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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