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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004233`

染色体: Chr07 坐标: 54650152-54650876 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004233`
名称	SmilChr07G004233
描述	probable thionin-2.4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54650152 - 54650876 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994973`
GeneID	`130994973`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994973`
原始查询	`SmilChr07G004233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable thionin-2.4
产物	probable thionin-2.4
Arabidopsis	`AT5G36910` (THI2.2) thionin 2.2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833659] identity=52.9; qcov=1.05; evalue=7.79e-38; confidence=medium
Rice	`Os06g0514100` (Osthi7) - identity=47.3; qcov=1; evalue=8.31e-28; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00321 (Thionin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994973

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057776175.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057776175.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776175.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776175.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54650281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:54650306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B105,B8,C25,C45
`Chr7:54650307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B105,B8,C25,C45
`Chr7:54650329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B105,B8,B99,C25
`Chr7:54650362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C25
`Chr7:54650367`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B8,C25
`Chr7:54650367`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B8,C25
`Chr7:54650374`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C25
`Chr7:54650374`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C25
`Chr7:54650383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:54650385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:54650394`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776175.1

129 aa

129

Thionin

PF00321 Thionin 28-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776175.1`	Pfam	`PF00321`	Thionin	Domain	28	70	2.2e-10	41.6	Plant thionin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920192.1
AGTGAATCACACAACACCTAGTATTTAAGTTGGAGTTTCATCAACATTTCTTCAATACAAATTAATTCTCTATATTTTGTAATACTCAAGAGAAGATTATATCCATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGGTGAGTCTTGTTTTGGGACGAATTCAAGTTGAGGCGTCACAGACTCTTTGTTGCCCAACCCGCGTTGCCAGAGTTCTCTATTATGCGTGTTCCGTTAAGAACCGAAGCGTAGAAGATTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994973
ATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGGTGAGTCTTGTTTTGGGACGAATTCAAGTTGAGGCGTCACAGACTCTTTGTTGCCCAACCCGCGTTGCCAGAGTTCTCTATTATGCGTGTTCCGTTAAGAACCGAAGCGTAGAAGATTGTGAACAAATGTCTGGATGCAAACACGTTGATGGGGAATGTCCCCCTGGTTTGGTTAACGACATTCTCGAAAACACTGCCAATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776175.1
MEAKSLIMSALLVSLVLGRIQVEASQTLCCPTRVARVLYYACSVKNRSVEDCEQMSGCKHVDGECPPGLVNDILENTANEYCKLGCASSVCAAITTLQNSDASEVVNGAVEKCRQACSAFCTKAAVETA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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