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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004238`

染色体: Chr07 坐标: 54798815-54799243 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004238`
名称	SmilChr07G004238
描述	CRS2-associated factor 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54798815 - 54799243 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994426`
GeneID	`130994426`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994426`
原始查询	`SmilChr07G004238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CRS2-associated factor 2, chloroplastic-like
产物	CRS2-associated factor 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G23400` (CAF2) RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838948] identity=49.6; qcov=0.965; evalue=4.63e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0323300` - identity=47.4; qcov=0.669; evalue=3.38e-15; confidence=low
GO	GO:0000373 (Group II intron splicing)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994426

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775453.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057775453.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775453.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775453.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54798849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B66,B75,C81,D8
`Chr7:54798860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A22,B83,C62,D3
`Chr7:54798886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:54798956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B69,B92,C21
`Chr7:54798971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:54798982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:54798989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr7:54799012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B10,B75,C21,C74,C81,D8
`Chr7:54799019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B45,B62
`Chr7:54799025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B121,B22,B27
`Chr7:54799035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B87
`Chr7:54799068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B8,C36,C47

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919470.1
ATGGCGATTCTCGCATCACTCCCAAATCCAAACCTCTTCTCATCCCTCCCCACCACCCCACCACCCTCCGCCCCCTCCCCGCCCCCCAAACCCCCAATTCCACCCCCCAAATACCCTCCGCCTTTAAAATCCCAGCGCCGCCAAAATCCAGACCCTTCCACCAACCCCGCCTTCACCGCCCACCACCGCAGCTCCAAATACTACAAGCCCGTCGAGCCCGGCCAGAAAATCCAACCCGCCAACGACGATCGCGCCGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994426
ATGGCGATTCTCGCATCACTCCCAAATCCAAACCTCTTCTCATCCCTCCCCACCACCCCACCACCCTCCGCCCCCTCCCCGCCCCCCAAACCCCCAATTCCACCCCCCAAATACCCTCCGCCTTTAAAATCCCAGCGCCGCCAAAATCCAGACCCTTCCACCAACCCCGCCTTCACCGCCCACCACCGCAGCTCCAAATACTACAAGCCCGTCGAGCCCGGCCAGAAAATCCAACCCGCCAACGACGATCGCGCCGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775453.1
MAILASLPNPNLFSSLPTTPPPSAPSPPPKPPIPPPKYPPPLKSQRRQNPDPSTNPAFTAHHRSSKYYKPVEPGQKIQPANDDRAVIVGHSGISYHLPGAPFEFMYSYSETPKAQPLAMREPAFLPTQAEFPRHLAPSAAVP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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