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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004254`

染色体: Chr07 坐标: 54976920-54981027 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004254`
名称	SmilChr07G004254
描述	AT-rich interactive domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54976920 - 54981027 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994830`
GeneID	`130994830`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994830`
原始查询	`SmilChr07G004254`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-rich interactive domain-containing protein 2-like
产物	AT-rich interactive domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G11400` (AT4G11400) ARID/BRIGHT DNA-binding, ELM2 domain and myb-like DNA-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826744] identity=39.1; qcov=0.645; evalue=3.77e-70; confidence=medium
Rice	`Os04g0166400` - identity=49.2; qcov=0.341; evalue=8.79e-54; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01388 (ARID)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994830

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775893.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775893.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775893.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775893.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54978477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B139,C47,C73,C77
`Chr7:54978507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:54980145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B36,C53,D11,D2
`Chr7:54980187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B36,D11,D2
`Chr7:54980205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B36,D11,D2
`Chr7:54980226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B2,D11
`Chr7:54980265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B47,B81,C59,C77
`Chr7:54980307`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B118,D2
`Chr7:54980307`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B118,D2
`Chr7:54980373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:54980460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:54980577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A8,B3,B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775893.1

684 aa

342

684

ARID

PF01388 ARID 50-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775893.1`	Pfam	`PF01388`	ARID	Domain	50	130	3.7e-11	44.0	ARID/BRIGHT DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919910.1
GACAAAGTATTATACCTATCCAAGATTTAGGGTTGGGTTCATCCCTAAGCTGTATGGTGCCCTCAGAAATCATCTAAATTACATCGTCTTTCGTCCCAAATTAATCTTCTTTATTTGAGGAAAAATCAAATACCTTTCACTCTTTTCCTTAAAATTCACCTGATTTCCTTTAAGGCCCCAGATTTCTATAATCTGTAGCCGTATCTCATGATCTGATTCTTCCTAAGACTGAGACAGCTAGCTAATCACCTGATTTTTTT...

XM_057919911.1
CAGAAATCATCTAAATTACATCGTCTTTCGTCCCAAATTAATCTTCTTTATTTGAGGAAAAATCAAATACCTTTCACTCTTTTCCTTAAAATTCACCTGATTTCCTTTAAGGCCCCAGATTTCTATAATCTGTAGCCGTATCTCATGATCTGATTCTTCCTAAGACTGAGACAGCTAGCTAATCACCTGATTTTTTTTGTATCCCTATCAATTATTGCTGCAGGGTTTATTATACATCGTCTTGCAATTCTCACTGGATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994830
ATGGTTAAGTTGAGAGATGGCAGTGGTGGTGGTGGCAACTTTGATGATGGAAATGATATAAAAACATTTAGGTTTGCTTTTGATCTCAATTTTCAGATAGAGAAGTACCGTTTTGATTCGTGTAAGCAGAGGCTAAAGAGTTTGTTTGATCAAGTTGTTGTTGCTTTTTTGAGAGATAAGTCTGCTGGCAAATTTCATAGGCCTATTCCTGCATTCTGTGGTGATGGGCAGCAAGTCGATTTGTTTAAGCTCTTTTGGCT...

LOC130994830
ATGAATTATTTGAACGAGCTGGATCGATGGCTACAACAAGTGTTTAGCAAGAGAGTGTTGGAGGATGACCATTGTGGGTTTATCCAAAAATTGGATTTATTGTCTCGGGAGTTGGAAGTTCGGTTCAAAGGTTTGTTGCCGGAGAAGCAAGAGCAAGAGCAGCTAGAGGAAGTTGCTATGTTTGTTGGAGAGGCAAATGACATGTCTCTTGTCATGATTGATGATTTTGCTTCATCAGCGAATAATGCAGCAGCGGAGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775893.1
MVKLRDGSGGGGNFDDGNDIKTFRFAFDLNFQIEKYRFDSCKQRLKSLFDQVVVAFLRDKSAGKFHRPIPAFCGDGQQVDLFKLFWLVRKFGGYDAVSRNNLWGFISEECGLGCGAIASLKLVYMNYLNELDRWLQQVFSKRVLEDDHCGFIQKLDLLSRELEVRFKGLLPEKQEQEQLEEVAMFVGEANDMSLVMIDDFASSANNAAAEIANEQNGISRGQDDDDGGIIGSAKKLIDNITNKVLNHRETIIAGDENDGE...

XP_057775894.1
MNYLNELDRWLQQVFSKRVLEDDHCGFIQKLDLLSRELEVRFKGLLPEKQEQEQLEEVAMFVGEANDMSLVMIDDFASSANNAAAEIANEQNGISRGQDDDDGGIIGSAKKLIDNITNKVLNHRETIIAGDENDGESSSPLGKNGSFVSAKKVDEVICRKPDFSEKVPDREERFRAQPSSDDKITSRSDAGNVLSSRKRKQEPRSFSGMLEWLVQAAKCPGDPSLGSIPECSKWSDGDGEFWAEALFVREALLIRRHDSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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