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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004262`

染色体: Chr07 坐标: 55044373-55045521 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004262`
名称	SmilChr07G004262
描述	uncharacterized SmilChr07G004262
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55044373 - 55045521 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994431`
GeneID	`130994431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994431`
原始查询	`SmilChr07G004262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G18636` (AT5G18636) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745990] identity=24.8; qcov=0.634; evalue=3.37e-20; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=32.8; qcov=0.487; evalue=7.08e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775457.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775457.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775457.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775457.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775457.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55044379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:55044380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B66,C58
`Chr7:55044381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr7:55044389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:55044392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr7:55044394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C47,C78
`Chr7:55044399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:55044450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:55044466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr7:55044470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B15,B24,B33
`Chr7:55044473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B41
`Chr7:55044506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775457.1

382 aa

191

382

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 32-108 aa PF14392 zf-CCHC_4 172-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775457.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	32	108	5.7e-19	68.3	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057775457.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	172	217	9.7e-16	57.9	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919474.1
ATGGAAGAACAGATGGCTTCTCTCAATTTGTCAAATGAAGATGATGAGCTGATCCTCGATGATGAGATTACTGCAGACTCGACAGTCTCCGTAGATCTGTGCTTGGTAGGAAGATTCCTTACGGATCAACCAATCAATTTCAATCTCATGCGAAGCCGACTGGCGAGTATCTGGCGACCGGGAAAAGGCGTTTTTATGAAAGATATTGGCCAAGGCAGATTTATCTTTCAGTTTTTTCATGAGCTTGATCTGAAGCGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994431
ATGGAAGAACAGATGGCTTCTCTCAATTTGTCAAATGAAGATGATGAGCTGATCCTCGATGATGAGATTACTGCAGACTCGACAGTCTCCGTAGATCTGTGCTTGGTAGGAAGATTCCTTACGGATCAACCAATCAATTTCAATCTCATGCGAAGCCGACTGGCGAGTATCTGGCGACCGGGAAAAGGCGTTTTTATGAAAGATATTGGCCAAGGCAGATTTATCTTTCAGTTTTTTCATGAGCTTGATCTGAAGCGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775457.1
MEEQMASLNLSNEDDELILDDEITADSTVSVDLCLVGRFLTDQPINFNLMRSRLASIWRPGKGVFMKDIGQGRFIFQFFHELDLKRVYEGGPWAFGNFPLILHRLKKGEFPLSVPLDLLPFWVQIHDLPAGFLTEGVGKLLGNFIGSFMEYDNTNSSGVWRQYMRIRVGIRVNDPLKRFKKLKQKDGTPFTVRFKYERLNVFCFLCGKLGHSESYCELLFNEKTKDMKREWGVDLKAADRRSPNLAGDKWLRVEDGGNPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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