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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004276`

染色体: Chr07 坐标: 55258866-55259702 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004276`
名称	SmilChr07G004276
描述	probable thionin-2.4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55258866 - 55259702 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994968`
GeneID	`130994968`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994968`
原始查询	`SmilChr07G004276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable thionin-2.4
产物	probable thionin-2.4
Arabidopsis	`AT1G66100` (AT1G66100) Plant thionin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842924] identity=50.4; qcov=1.1; evalue=1.2e-34; confidence=medium
Rice	`Os06g0514100` (Osthi7) - identity=52; qcov=1.05; evalue=2.9e-33; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00321 (Thionin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994968

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057776168.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776168.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776168.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776168.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776168.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55259029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B134,B81,C51
`Chr7:55259045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B9,D3
`Chr7:55259076`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A7,B104,B11,B12,B123,B136,B139,B22,B55,B69,B98,B99,C1,C7,D1,D8
`Chr7:55259077`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A7,B104,B11,B123,B136,B139,B22,B55,B69,B98,C1,C7,D1,D8
`Chr7:55259086`	`GC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B23,B59,C15,C59,C79
`Chr7:55259091`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A3,B123,B136,B137,B22,B69,B98,C1,C43,C48,C7,C76,D1,D8
`Chr7:55259095`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A3,A7,B123,B136,B137,B22,B69,B98,C1,C43,C48,C7,C74,C76,D1,D8
`Chr7:55259109`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B23,B59,C15,C59,C79
`Chr7:55259109`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B23,B59,C15,C59,C79
`Chr7:55259116`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B23,B59,C15,C59,C79,D4
`Chr7:55259125`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	112	A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A7,A8,B1,B101,B102,B11,B110,B112,B113,B114,B118,B119,B123,B124,B13,B134,B135,B137,B14,B17,B20,B21,B22,B26,B27,B29,B30,B34,B36,B38,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B5,B50,B53,B57,B58,B60,B62,B64,B66,B69,B73,B74,B76,B77,B8,B80,B84,B89,B90,B92,B94,B95,B99,C13,C18,C2,C22,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C36,C39,C4,C45,C46,C47,C48,C52,C54,C6,C61,C62,C63,C67,C68,C7,C72,C73,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C86,C87,D10,D11,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr7:55259138`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	80	A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A8,B1,B101,B102,B110,B112,B114,B119,B123,B124,B135,B20,B21,B22,B26,B27,B29,B30,B38,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B5,B53,B58,B60,B64,B66,B69,B73,B74,B76,B77,B80,B84,B89,B90,B95,B99,C13,C18,C2,C25,C26,C27,C29,C30,C36,C45,C46,C52,C54,C6,C61,C62,C63,C67,C68,C7,C73,C78,C79,C80,C81,C82,C87,D3,D5,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776168.1

119 aa

119

Thionin

PF00321 Thionin 25-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776168.1`	Pfam	`PF00321`	Thionin	Domain	25	66	6.6e-11	43.2	Plant thionin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920185.1
GCACGCATTTTGTTAGATAAGGTGGTAGGTGAATGACCCAATACCTAGTATTTAAGTTGGAGTTTGATCAGCAGCATTTCATCCATCAATACAAATTAATTCTGTGTATTTTGTAATATATCAGAGAAGATCACATCCATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGGTGAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAAAGAGTTGTTGCTCAACCACCAATGCCAGAAATATCTATAATACCTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994968
ATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGGTGAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAAAGAGTTGTTGCTCAACCACCAATGCCAGAAATATCTATAATACCTGTCGCCTTATAGAGGGCTCCGAGTTAGCTTGTGCAAAACTCAGTGGATGCAAACTTACTGATGATAGGAATGCATGTCCCACTGTCGATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCCGTTTGCGCTGCCATAACCACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776168.1
MEAKSLIMSALLVSLVLGQIQVEAKSCCSTTNARNIYNTCRLIEGSELACAKLSGCKLTDDRNACPTVDEYCKLGCASSVCAAITTLQNSDASEVVNGAVEKCNQACSAFCTKGSIIAT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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