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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004289`

染色体: Chr07 坐标: 55452141-55458400 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004289`
名称	SmilChr07G004289
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55452141 - 55458400 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994832`
GeneID	`130994832`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994832`
原始查询	`SmilChr07G004289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
Arabidopsis	`AT5G20170` (AT5G20170) RNA polymerase II transcription mediator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832140] identity=53.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0638600` (OsMed17_1) - identity=45.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex); GO:0070847 (core mediator complex)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994832

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775896.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057775896.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775896.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775896.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775896.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55452431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B98,C78
`Chr7:55452498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67
`Chr7:55452554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B31,B40,B82,B89
`Chr7:55453046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B40
`Chr7:55453109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C24
`Chr7:55453196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:55453231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C14,C34
`Chr7:55453510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B12,C58
`Chr7:55453667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B71,C16
`Chr7:55453686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B80,B94,C80
`Chr7:55453735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr7:55453744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C31,C53,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919913.1
ATTAATTTAATAATTAAATTTTAATTTGAGTTGGGAATCGGTCACGTATGTCACTTTCCCTCTTCTCACTCTCGTCTCTCTGCCTCTCTCACCCTCTCTCGTCTCCGGCCTCTCTCTGCCGTCCGCCGGTCGCCAACGCCGCCGCCCTCGCCGGCTCACCTCGCGCGCAGCAGCAGCTGCCTCCGTCAACTAGCAGGTTGCCATGAAAGTATTGGTCCCACCTGAATCTATTTGAAGGCCCTGAAAAGTTATTGCAGGCT...

XM_057919914.1
TGGGAATCGGTCACGTATGTCACTTTCCCTCTTCTCACTCTCGTCTCTCTGCCTCTCTCACCCTCTCTCGTCTCCGGCCTCTCTCTGCCGTCCGCCGGTCGCCAACGCCGCCGCCCTCGCCGGCTCACCTCGCGCGCAGCAGCAGCTGCCTCCGTCAACTAGCAGCAGGTTGCCATGAAAGTATTGGTCCCACCTGAATCTATTTGAAGGCCCTGAAAAGTTATTGCAGGCTTCTGTGCTAATTGACTACTCTTTCTCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994832
ATGGATGGAGATCTTGAAATCTCACTAGACAAGCTTCCGATCAAACGACTTGATGCCATTGAGGAAAATGGCTTTGAACGCTTCCCCACAGATGTGGGTTATGATGAAAAGAGAGTGAACTTGGTGAGGAGAATAGACTTTGCATGGGCCGTAGAGAGAGAGGATCCCAATAAGAAGCGGAAGAGTGAAGGTGCGAGTGCCAAGGAGGGTGCGACATCCAGTCAGCAACAATGGCAATGGCAGAGTTTAGTGGAGAATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775896.1
MDGDLEISLDKLPIKRLDAIEENGFERFPTDVGYDEKRVNLVRRIDFAWAVEREDPNKKRKSEGASAKEGATSSQQQWQWQSLVENLQLAHQELSVIIDLINTVEANDAVTVAGMTRPKQLPNEHLSDLAVSTATKLQCFRGLGKYLKQSAKALEEQVAREARFYGALIRLQQNWKIKRHRLVAAASGNEGFYIDLFDSSLYDLASVFRPSSMSTIPVEHDAAGMLTVNLPHKSCHSLQFEFLGLNPSYKLTRSGETKTQ...

XP_057775897.1
MDGDLEISLDKLPIKRLDAIEENGFERFPTDVGYDEKRVNLVRRIDFAWAVEREDPNKKRKSEGASAKEGATSSQQQWQWQSLVENLQLAHQELSVIIDLINTVEANDAVTVAGMTRPKQLPNEHLSDLAVSTATKLQCFRGLGKYLKQSAKALEEQVAREARFYGALIRLQQNWKIKRHRLVAAASGNEGFYIDLFDSSLYDLASVFRPSSMSTIPVEHDAAGMLTVNLPHKSCHSLQFEFLGLNPSYKLTRSGETKTQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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