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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004294`

染色体: Chr07 坐标: 55490154-55492501 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004294`
名称	SmilChr07G004294
描述	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55490154 - 55492501 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994961`
GeneID	`130994961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994961`
原始查询	`SmilChr07G004294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, chloroplastic/mitochondrial
产物	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G32915` (AT4G32915) glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829428] identity=64.2; qcov=0.709; evalue=7.62e-44; confidence=medium
Rice	`Os03g0651000` (GATC) - identity=72.9; qcov=0.716; evalue=9.58e-46; confidence=medium
GO	GO:0006450 (regulation of translational fidelity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0050567 (glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing) activity); GO:0070681 (glutaminyl-tRNAGln biosynthesis via transamidation)
KEGG	smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02686 (GatC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776158.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057776158.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776158.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776158.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55490369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:55490413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:55492370`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B40,C2
`Chr7:55492370`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B40,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776158.1

134 aa

134

GatC

PF02686 GatC 56-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776158.1`	Pfam	`PF02686`	GatC	Family	56	127	4.6e-14	53.1	Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920175.1
AATCTTATTCTATTGGGCTCGGGCTTAAGACCATTAGAATCTTTTCGTTTAGAGAGAGAGACTCCATTCATCATCTCTCATCGTCAGAATGGGTAGCAGAGCAGTTATGCTTCTTCGAGCTAATCCGCAGTTCTTCAGCTTCAGAAACGGCGCTTTTCCAAAAGCATTTCAACCGAGTAAGCGATTTTACGCGGCGAAGTATAGTCTCGAGCCGCCGGATGTTCCGCGTTTGGCTGAGAAAGCTCGGATTTCTCTCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994961
ATGGGTAGCAGAGCAGTTATGCTTCTTCGAGCTAATCCGCAGTTCTTCAGCTTCAGAAACGGCGCTTTTCCAAAAGCATTTCAACCGAGTAAGCGATTTTACGCGGCGAAGTATAGTCTCGAGCCGCCGGATGTTCCGCGTTTGGCTGAGAAAGCTCGGATTTCTCTCTCCCCAAAACAAGTCGAAGAATTTGCTCCCAAAATTCGGCAAGTGGTAGACTGGTTTGGGCAGCTTCAGGCCGTAGACCTTCAGAGTATCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776158.1
MGSRAVMLLRANPQFFSFRNGAFPKAFQPSKRFYAAKYSLEPPDVPRLAEKARISLSPKQVEEFAPKIRQVVDWFGQLQAVDLQSIEPAIRADTEGDNLRDDVPQVFDNRDAIIAAVPNYEDSYIKVPKVLNKE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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