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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004297`

染色体: Chr07 坐标: 55568973-55570577 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004297`
名称	SmilChr07G004297
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 20-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55568973 - 55570577 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994909`
GeneID	`130994909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994909`
原始查询	`SmilChr07G004297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 20-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 20-like
Arabidopsis	`AT4G29190` (OZF2) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829040] identity=50.9; qcov=1.04; evalue=6.64e-97; confidence=high
Rice	`Os01g0192000` (DOS) - identity=43.5; qcov=1.13; evalue=8.84e-78; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH); PF25512 (zf-CCCH_AtC3H23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776026.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776026.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776026.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776026.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55569252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B26,B36,D6
`Chr7:55569262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr7:55569337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B26,D6
`Chr7:55569380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr7:55569550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B120,B42,B43,C6
`Chr7:55569558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr7:55569607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,A7,B47,C9
`Chr7:55569741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:55569798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr7:55569815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:55569832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr7:55569899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C50,C77,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776026.1

339 aa

170

339

zf-CCCH_AtC3H23

zf-CCCH

PF25512 zf-CCCH_AtC3H23 75-108 aa PF00642 zf-CCCH 120-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776026.1`	Pfam	`PF25512`	zf-CCCH_AtC3H23	Domain	75	108	1.2e-20	73.7	AtC3H23-like, CCCH zinc finger
`XP_057776026.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	120	141	1.8e-06	28.4	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920043.1
ATAAAAATAAATAACATAAACTAATGGTAGATATTTTAATCTAACCGTGGTTGAGTCAACGCCTTTAACCATGGTTAAATTTTCAGTTTATATGGGAAGCCCCGCTTCCGAGTTCTTAGTGATCATGACAGTGCTGTTTGAGCGAAGTTGAACAAAGAGAAGGAAAAAAAAATAATCAAAATTATAAAAAAAAAAGAAGGTCAAAAAAAGGGGGAAAAAAGAACACGATGATGATGACCGGAGATCATCCTCGGTCAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994909
ATGATGATGACCGGAGATCATCCTCGGTCAAATCCGACCGTCAAAATCCCTAGCTGGGACTACGGAGAGGAACCGACGGCGCACATTCAATCCCCAATCTCCGGAGCCCTAAGCAGCCAATACGACGCGGCGCTGGCGGCGCTGCAGCGCTACCTCCCGGGGAACCGCGACGACGACGGCGTGCCGGGGTTCGACGACTCCGGCGACGCCTTCTCCTGCGACGACTTCCGCATGTTCGAGTTCAAGGTGCGGCGCTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776026.1
MMMTGDHPRSNPTVKIPSWDYGEEPTAHIQSPISGALSSQYDAALAALQRYLPGNRDDDGVPGFDDSGDAFSCDDFRMFEFKVRRCAIARSHDWTDCPFAHPGEKARRRDPRRHHYSGGACPDFRRAGDCARGDACEYAHGVFESWLHPARYRTQPCKDGTGCRRRVCFFAHTPEQLRVLPPLTTSPDASPIGVSPRSAAMYSPPPSSPTAGSPPISPSMSLSSVTESMRCLQLSKMKMGMKLSMSPPSWGIGLGLGPGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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