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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004298`

染色体: Chr07 坐标: 55572249-55573464 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004298`
名称	SmilChr07G004298
描述	uncharacterized SmilChr07G004298
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55572249 - 55573464 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994437`
GeneID	`130994437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994437`
原始查询	`SmilChr07G004298`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=24.3; qcov=0.748; evalue=4.15e-14; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.4; qcov=0.78; evalue=1.25e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775462.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057775462.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775462.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775462.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775462.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55572261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B137,B70,C61
`Chr7:55572267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:55572416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A18,B133,B41,B91,C19,C46,D10
`Chr7:55572442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C14,C74
`Chr7:55572535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:55572545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B120
`Chr7:55572587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B18,B55,C81
`Chr7:55572605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B12,B53,B55
`Chr7:55572605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B53,B55
`Chr7:55572606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A1,A13,B10,B120,B15,B2,B36,B66,B83,C22,C29,C35,C5,C59,C76
`Chr7:55572618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A2,A20,B110,B120,B132,B41,B42,B43,B58,B62,B72,C54,C6
`Chr7:55572728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B17,B27,B36,B52,B63,B81,B87,B96,B98,C16,C22,C34,C51,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775462.1

369 aa

184

369

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 171-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775462.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	171	265	1.5e-17	64.7	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919479.1
ATGACATGTCCAGAAAATGAAAGTAGTATACTCGTTATAGACGTCAAATCGAGAAAGTTGTGGGCAGATATAGTGAGATCCTTATATGGGGAGATCGTGTGGGACGAGGAGGGGCTGAAACTTGTTGGAACAAACAGGATTAAGGGCGGTTGGTGGCCAAAAATTGTCTCATTAGCTGGTGGGCAGTCCGGGAAATGGTTTGTGGATAACATTGATCGCAAGGTTGGGAACGGGAGAGATACAAAATTCTGGGAGCATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994437
ATGACATGTCCAGAAAATGAAAGTAGTATACTCGTTATAGACGTCAAATCGAGAAAGTTGTGGGCAGATATAGTGAGATCCTTATATGGGGAGATCGTGTGGGACGAGGAGGGGCTGAAACTTGTTGGAACAAACAGGATTAAGGGCGGTTGGTGGCCAAAAATTGTCTCATTAGCTGGTGGGCAGTCCGGGAAATGGTTTGTGGATAACATTGATCGCAAGGTTGGGAACGGGAGAGATACAAAATTCTGGGAGCATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775462.1
MTCPENESSILVIDVKSRKLWADIVRSLYGEIVWDEEGLKLVGTNRIKGGWWPKIVSLAGGQSGKWFVDNIDRKVGNGRDTKFWEHRWVGTKPLKFVFPRLFYLSDNKDSTISELGNWEEGVWVWDLKWRRVLFDREVTATNDLLSFISGTSPITGCADGWIWRATKEGMYTTKSAYEVIKGLGNEALVETCNRERLAKIWNIQAPQKTRVTTWRILRDRLPTCENLRKRNIPLGEEEIMCNACCQHLETTNHLLLSCPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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