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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004299`

染色体: Chr07 坐标: 55573542-55582349 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004299`
名称	SmilChr07G004299
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 32 homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55573542 - 55582349 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994943`
GeneID	`130994943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994943`
原始查询	`SmilChr07G004299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 32 homolog 2-like
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 32 homolog 2-like
Arabidopsis	`AT2G19830` (SNF7.2) SNF7 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816502] identity=81.4; qcov=1.03; evalue=5.03e-108; confidence=high
Rice	`Os06g0608500` (OsSNF7) - identity=77; qcov=1.01; evalue=3.12e-99; confidence=high
GO	GO:0000815 (ESCRT III complex); GO:0005771 (multivesicular body); GO:0006900 (vesicle budding from membrane); GO:0009898 (cytoplasmic side of plasma membrane); GO:0032511 (late endosome to vacuole transport via multivesicular body sorting pathway)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03272 (Virion - Hepatitis viruses - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03357 (Snf7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776123.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057776123.1`
3	Midbody	Midbody	1.00000	`XP_057776123.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776123.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.60000	`XP_057776123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55578646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B104,B99
`Chr7:55578685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C45
`Chr7:55581803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776123.1

214 aa

107

214

Snf7

PF03357 Snf7 20-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776123.1`	Pfam	`PF03357`	Snf7	Family	20	185	1.3e-45	155.9	Snf7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091946.1
TAAGCTCACCACCCAATCCAATTGGTCTGTCGTGTGCCCTACGCTGAACGCGCAGTCATCCGATACTTCACCGCGTCACTGCCCTCTAAAACGCGGAAGAAAACAAGTCTTCCAAACAACGACTTCTACTTCATCGTATAAATTCACAAAGTTCAATCGAAATTCGCTGCGAAAACTTGAATCCGTACATATTTACCGGGAAAACCAAGGCCGATTATTGTCGGTCCAAAGCCTCAGGGTTTAAGGACATAATTTTTGCT...

XR_009091947.1
TAAGCTCACCACCCAATCCAATTGGTCTGTCGTGTGCCCTACGCTGAACGCGCAGTCATCCGATACTTCACCGCGTCACTGCCCTCTAAAACGCGGAAGAAAACAAGTCTTCCAAACAACGACTTCTACTTCATCGTATAAATTCACAAAGTTCAATCGAAATTCGCTGCGAAAACTTGAATCCGTACATATTTACCGGGAAAACCAAGGCCGATTATTGTCGGTCCAAAGCCTCAGGGTTTAAGGACATAATTTTTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994943
ATGTTTACGCGGATTTTTGGAAAGCCCAAGCAAGAGACAAATGCTCTGGCAACATTAGATAAGTTGAACGAGACTCTTGAGATGCTAGAGAAAAAAGAGAAAGTTCTCTTGAAAAAGGCTGCTGGAGAAGTTGAGAAGGCCAAAGAATTCACTAAAGCTAAAAATAAAAGGGCTGCTATACAATGTTTGAAAAGGAAAAGGCTTTATGAGCAACAAATTGAGCAGCTGGGGAATTTTCAGTTACGCATTCATGATCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776123.1
MFTRIFGKPKQETNALATLDKLNETLEMLEKKEKVLLKKAAGEVEKAKEFTKAKNKRAAIQCLKRKRLYEQQIEQLGNFQLRIHDQMIMLEGAKATTETVDALRTGAAAMKAMQKATNIDDVDKTMDEINEQTENMKQIQDALSAPIGAAADFDEDELEAELEELEGAELEEQLLQPATTAPAAPIRVPAGRQPAHKVEEEDDELAELQREMAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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