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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004301`

染色体: Chr07 坐标: 55597509-55599421 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004301`
名称	SmilChr07G004301
描述	uncharacterized SmilChr07G004301
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55597509 - 55599421 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994900`
GeneID	`130994900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994900`
原始查询	`SmilChr07G004301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824397]; symbol=AT3G52320; hit=AT3G52320; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824397]; symbol=AT3G52320; hit=AT3G52320; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G52320` (AT3G52320) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824397] identity=25.2; qcov=0.67; evalue=1.45e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776011.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057776011.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057776011.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057776011.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776011.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55597697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:55597864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B139,C35,C56,C87
`Chr7:55597886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B8,C78,C85
`Chr7:55597886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C78,C85
`Chr7:55597896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr7:55597923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	66	A10,A19,A22,A23,A25,A9,B107,B11,B114,B120,B124,B127,B128,B129,B130,B131,B135,B14,B15,B16,B17,B22,B29,B37,B4,B45,B47,B49,B53,B67,B68,B71,B8,B80,B86,B90,B95,B97,C15,C16,C18,C23,C24,C33,C37,C40,C41,C47,C48,C53,C55,C60,C7,C72,C73,C75,C78,C80,C82,C83,C85,C86,D1,D10,D2,D7
`Chr7:55597928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B139,C13,C35
`Chr7:55598102`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B41,B60,B72,B9,C10,C39,C44,C59
`Chr7:55598206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:55598207`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A1,A15,A20,B102,B103,B106,B108,B110,B124,B128,B132,B136,B34,B45,B46,B56,B61,B63,B64,B73,B83,B89,B94,B98,B99,C13,C14,C21,C27,C28,C3,C34,C39,C42,C51,C52,C62,C64,C67,C75,C76,C77,D1,D4,D5,D8
`Chr7:55598235`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	82	A1,A14,A15,A16,A20,A4,B102,B103,B106,B108,B112,B119,B128,B130,B132,B133,B136,B139,B19,B20,B21,B26,B27,B34,B36,B42,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B56,B61,B63,B73,B79,B80,B83,B89,B94,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C14,C20,C21,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C36,C39,C42,C43,C46,C51,C52,C60,C62,C63,C64,C67,C68,C74,C75,C77,C79,C82,D1,D10,D4,D5,D8
`Chr7:55598290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776011.1

367 aa

184

367

F-box

PF00646 F-box 6-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776011.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	6	45	1.3e-06	28.8	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920028.1
ACTCCGACGCCTCGTTTTACACAGTTCACTGGAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGAAATGTTTCGTTTGAAACCAGCCTTCCGCAAGCCACCGCCTCCTGCACTGACGACAGCCATCCCGACATTCTTAGTAGAGCTTAATTAGATGATATGCATTAGAAGTCGGGCTTTATTATTTCCGGAGGTGTAAAAAGGGGATGCCAACAAACATAGAGTCCCTCCACACAGACCTATTGTTCGAAATCCTCCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994900
ATGCCAACAAACATAGAGTCCCTCCACACAGACCTATTGTTCGAAATCCTCCTCCGTTTGCCGGCCGATCATCTCTACGAGAGAGCGAGGCTCGTGTGCCGGCAGTGGTACCACATTATCCATTCTCATGCCTTCATCAACGCGCAGATGCACGGTGCTACCTATGGACTCCTCCTATCACCCATAAAGGGTTATACTCTGCCACTTTATGTAACAGCCACCACAGACGGCGGAATCCACACATCTGAGCTAACTTACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776011.1
MPTNIESLHTDLLFEILLRLPADHLYERARLVCRQWYHIIHSHAFINAQMHGATYGLLLSPIKGYTLPLYVTATTDGGIHTSELTYLFKREVLATNNGLAVEIDSKCYFLPRLVNPATKQSLLLPPLPIGVRVFYAPFKYGFAYSAASLAYKVIAPYVVTQSPPPQKTDYGLDVLTVGINESWRHVEVHHLPDHVRPFFFDKAPLTSEGFLHWGSGRYCVTLDVETEIITLSEAPYEYNERDYYYLSTGRCLSLLIACGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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