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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004319`

染色体: Chr07 坐标: 55731195-55740315 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004319`
名称	SmilChr07G004319
描述	uncharacterized SmilChr07G004319
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55731195 - 55740315 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994439`
GeneID	`130994439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994439`
原始查询	`SmilChr07G004319`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817137]; symbol=AT2G25970; hit=AT2G25970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817137]; symbol=AT2G25970; hit=AT2G25970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G25970` (AT2G25970) KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817137] identity=52.5; qcov=0.984; evalue=5.68e-136; confidence=high
Rice	`Os08g0110800` - identity=55.2; qcov=0.286; evalue=1.37e-55; confidence=weak
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00013 (KH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775464.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057775464.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775464.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775464.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775464.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55735777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:55735831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B47,C80
`Chr7:55735880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:55735934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:55735940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr7:55735956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,B68
`Chr7:55735974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:55736016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:55736043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B93
`Chr7:55736082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:55736178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B94
`Chr7:55736226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775464.1

633 aa

316

633

KH_1

PF00013 KH_1 122-188 aa PF00013 KH_1 216-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775464.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	122	188	4.3e-37	126.4	KH domain
`XP_057775464.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	216	280	4.3e-37	126.4	KH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919481.1
AGCAATTATTATTTTATTCCTCTCCTCTGCGCTCTCACTCATCAAGGGTTTTTGCTACTCTCCCCTTTTCGGCTTCAAAATGGCGGACGATGTGCTCTACGCCGCCGCCGCCGGCGATTCCAACAAGCGCAAGTACGAGGAATCACCGTCGCCGGTCGCGCGCAGGGCGACGGGATTCTCGTCGACGCCGGACGCGGCGCCGCCGCCTTCGTTCAACAACGTTCCTCCCCCGATGAACGAGATCGAGCTGGCGAAGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994439
ATGGCGGACGATGTGCTCTACGCCGCCGCCGCCGGCGATTCCAACAAGCGCAAGTACGAGGAATCACCGTCGCCGGTCGCGCGCAGGGCGACGGGATTCTCGTCGACGCCGGACGCGGCGCCGCCGCCTTCGTTCAACAACGTTCCTCCCCCGATGAACGAGATCGAGCTGGCGAAGCAGAAGGCGCAGGAGATCGCCGCGAGGCTCCTGAACAACTCCGATCCGACGAAGAGAGCCAGAGTTGAGAATGTGGGGAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775464.1
MADDVLYAAAAGDSNKRKYEESPSPVARRATGFSSTPDAAPPPSFNNVPPPMNEIELAKQKAQEIAARLLNNSDPTKRARVENVGNGGRGFDSSDYSSQKSSGYGLSGPPQAASSGYPGPSKRIEIPNGRVGVIIGKGGETIKYLQLQSGAKIQVTRDVDADPNSATRGVDLMGTPDQIAKAEQLIQDVLSEAETGGSGSTSRRVGGQSSGAEQFVMKIPNNKVGLVIGKGGETIKSMQARTGARIQVIPLHLPPGDTSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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