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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004328`

染色体: Chr07 坐标: 55848640-55855926 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004328`
名称	SmilChr07G004328
描述	putative F-box protein At5g52610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55848640 - 55855926 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994887`
GeneID	`130994887`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994887`
原始查询	`SmilChr07G004328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At5g52610
产物	putative F-box protein At5g52610
Arabidopsis	`AT3G52320` (AT3G52320) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824397] identity=25.7; qcov=0.634; evalue=9.12e-08; confidence=low
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=28.4; qcov=0.547; evalue=8.6e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994887

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775991.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775991.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775991.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775991.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55848802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B11,B15,B67,C35
`Chr7:55848965`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr7:55848965`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr7:55849096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:55849110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:55849173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr7:55849174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B41
`Chr7:55849256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C1
`Chr7:55849271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B129,C67,C82
`Chr7:55849370`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr7:55849370`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr7:55849606`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775991.1

393 aa

196

393

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 37-77 aa PF12937 F-box-like 39-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775991.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	37	77	1.4e-08	35.0	F-box domain
`XP_057775991.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	39	75	5.5e-07	30.0	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920008.1
CACTATCACTTTTTAATATTTGTCTTCTTCTTGTCTACTACACAACACGGCTGCCTCCCTTTTCCTTGCCAAAAACCCTAGCATAACCGTGCACGACTGCATCCATTTCCCTTGCAAAAAAAAAATCATGAAATTTGTTTAAAGAATTCGTGCACGTCTGCCTCCCTTCCATATTTCTTGAAGAAATCGTGTAAAGAACCGTGTAAAACAACCGTGCGTGCATCCCATAGCAAACAACCGTGTAAACAAATCGTGCTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994887
ATGCCTCGTAAGAAACCAGTCTTCCGCAAGCCGCCACCGCGCCGCTGCTGCACCGACGGCAGCGTTTCGGATCCGCATTCCAACATTCTTAGTAGAGAATCGATAAACATAGAGTCCTTCCCCACAGACCTATTGTTCGAAATCCTCCTCCGTTTGCCGGCCGATCATCTCTACCAGAGAGCGAGGCTCGTGTGCCGGCGGTGGTACCACATTATCCATTCTCATGCCTTCATCAACGCGCAGATGCACTGCTCTACCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775991.1
MPRKKPVFRKPPPRRCCTDGSVSDPHSNILSRESINIESFPTDLLFEILLRLPADHLYQRARLVCRRWYHIIHSHAFINAQMHCSTYGLLLSPLNWSNTLPLYVTADADGGIHTSDLNHISKLEVLATSCNGLALEFDFKDRLLRLVNPAKKQSLLLPRLTRGATYAWPEYGFAYSAASLAYKVIARYTVCHSPQRLQTDYGLDVLTVGVNESWRHVEVPHHLSPFFFNKAPLTTEGFMHWGRGRYCVTMDVETEIITLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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