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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004331`

染色体: Chr07 坐标: 55874777-55876576 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004331`
名称	SmilChr07G004331
描述	uncharacterized SmilChr07G004331
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55874777 - 55876576 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994885`
GeneID	`130994885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994885`
原始查询	`SmilChr07G004331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G21280` (AT1G21280) Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724] identity=32; qcov=0.559; evalue=1.29e-36; confidence=low
Rice	`Os01g0909600` - identity=26.6; qcov=0.312; evalue=2.31e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14244 (Retrotran_gag_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775989.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775989.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775989.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775989.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775989.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55874884`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B25,B27,B33,B39,B44,B78,C46,C6,C61,C64,C66,C73,C8,D9
`Chr7:55874889`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B111,B132,B77,B89,C17,C27,C30,C5,C75,C76
`Chr7:55875246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:55875279`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B127,C15
`Chr7:55875279`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B127,C15
`Chr7:55875285`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C15
`Chr7:55875285`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C15
`Chr7:55875291`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C15
`Chr7:55875291`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C15
`Chr7:55875298`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C15
`Chr7:55875298`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C15
`Chr7:55875316`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775989.1

397 aa

198

397

Retrotran_gag_3

PF14244 Retrotran_gag_3 28-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775989.1`	Pfam	`PF14244`	Retrotran_gag_3	Domain	28	73	3.4e-18	65.9	Gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920006.1
TTTTCCACGTCCTCTTCTTAAACACGTATTACATGTGAAGAGGGCACTGGTATAAATAGGAAGCTGAGCTTCGTTTGTAATTCATTCACTCATATAATAAAATCTTCTCTTCTATCTTCATGTCATCTTCTCTCTCGAACATGGTATCCAGAGCAACGTATTTCCGCTGATTTTGTGCTCTTCAATGGCGCCTCCAACACCTCCACTCAAGCAACAACAACATCAGCCTCCTTATGAGGACGCATCTAGCCCTTATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994885
ATGGCGCCTCCAACACCTCCACTCAAGCAACAACAACATCAGCCTCCTTATGAGGACGCATCTAGCCCTTATTTTCTGCCGCACAGTGATAATCCTGGTGTGCAGCTGGTTACGCAGCAGTTAAATGGTTCCAATTACTCAAATTGGCACCGATCTATGACAACGGCGCTTATAGCGAAGAATAAGCTGGCGTTTGTCGACGGATCTCTCGAGCATCCTCACCACACTGATCTGCTATTCACGCAATGGATGCGGTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775989.1
MAPPTPPLKQQQHQPPYEDASSPYFLPHSDNPGVQLVTQQLNGSNYSNWHRSMTTALIAKNKLAFVDGSLEHPHHTDLLFTQWMRCNSMVVSWLRNSVIPEISSSIMYIDDAYHIWNDLRERFSQGNLARICQLKQQLFNLKQGAEDVSTYFTNLRILWDEYKDFQPSRWCTCDHCRCHSARRWNDFQMQECSMQFLIGLNSTYSQIRSQIISTTPFPSLSKIFSLVLQEERQRSIEFGLPQSSLTNTEVQGSLINATGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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