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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004339`

染色体: Chr07 坐标: 55946040-55948455 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004339`
名称	SmilChr07G004339
描述	uncharacterized protein ycf36-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55946040 - 55948455 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994934`
GeneID	`130994934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994934`
原始查询	`SmilChr07G004339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YCF36, putative (DUF1230) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831057]; symbol=AT5G11840; hit=AT5G11840; species=arabidopsis; confidence=high
产物	YCF36, putative (DUF1230) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831057]; symbol=AT5G11840; hit=AT5G11840; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G11840` (AT5G11840) YCF36, putative (DUF1230) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831057] identity=60.3; qcov=1.06; evalue=7.59e-104; confidence=high
Rice	`Os05g0539900` - identity=61.7; qcov=0.478; evalue=2.58e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06799 (CGLD27-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776094.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057776094.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057776094.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057776094.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55946363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B102
`Chr7:55946415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:55946547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B112,B118,B36,C48
`Chr7:55946562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:55946631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C40,C50,C54
`Chr7:55948004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B126,B66
`Chr7:55948018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:55948088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:55948089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B4,C17,C35,C60
`Chr7:55948122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:55948132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B5,B57
`Chr7:55948153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776094.1

251 aa

126

251

CGLD27-like

PF06799 CGLD27-like 49-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776094.1`	Pfam	`PF06799`	CGLD27-like	Family	49	192	1.1e-54	185.2	Conserved in the green lineage and diatoms 27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920111.1
ATTTGTCACCATGTTTTTCATTCTCCCTCTCCTTTTCTTGTTCACCACATCATATTTCTTTCCATACGCAACAAAAAACTTCTCTCCCAACCTCAACTAATCAAATTATCCAAACCCAAACCCAATAAAAAAAATCCCAAATAAATAAATAAACAAAAAACTTGCATATAGAGAGAGAATGGCCACCACCTCCTTTCTCTCTCTAAAACCACTCTCCTCACCGCCTCTCACCTTCCCCTCCACCCACCACCACCACCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994934
ATGGCCACCACCTCCTTTCTCTCTCTAAAACCACTCTCCTCACCGCCTCTCACCTTCCCCTCCACCCACCACCACCACCACCACCTCATCAAATTCCCCAAAATACCCCTGTCATCTTTCAATTATGACAACAACACCCCAGAGTGCCCGGTCCCACCGGAGCAGCAGCCAATCAACGAGTTCCACTCTCTCTCCAACTCCTTCCCTTTCTCGTGGGCGTCAAGCGACGTCGTCGAGTACTCCTCCCGGCTGCTGGCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776094.1
MATTSFLSLKPLSSPPLTFPSTHHHHHHLIKFPKIPLSSFNYDNNTPECPVPPEQQPINEFHSLSNSFPFSWASSDVVEYSSRLLAVGACFAVFVGLPISWFGSIGPKSEPVKLIMGCVASGLFVVIVAVVRMYLGWAYVGNRLLSATVEYEETGWYDGQIWVKTAEVLARDRLLGSFSVKPVLGRLKNTLVFLGISLLMCIVPFVNSDGQKRGVIPPAEPGGRAVPGVYNDESARNFEPEAFCGGEAVDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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