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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004347`

染色体: Chr07 坐标: 56008962-56012502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004347`
名称	SmilChr07G004347
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56008962 - 56012502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994892`
GeneID	`130994892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994892`
原始查询	`SmilChr07G004347`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
产物	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
Arabidopsis	`AT5G51160` (AT5G51160) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835190] identity=28.4; qcov=0.878; evalue=2.46e-28; confidence=low
Rice	`Os11g0434400` - identity=24.4; qcov=0.936; evalue=1.61e-19; confidence=weak
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008157 (protein phosphatase 1 binding); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity); GO:0035304 (GO:0035304)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775995.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775995.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775995.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775995.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56009103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,C1,C11,C57,C69
`Chr7:56009202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:56009217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C14
`Chr7:56009231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:56009256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C10
`Chr7:56009268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B126,B135,B66
`Chr7:56009306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B34,B36,C18,C29
`Chr7:56009363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A25,B106,B60,C14
`Chr7:56009364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:56009493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr7:56009541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C50,C56
`Chr7:56009564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C26,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775995.1

377 aa

188

377

Ank_2

Ank_4

Ank_2

Ank_4

Ank_3

Ank

PGG

PF12796 Ank_2 10-98 aa PF13637 Ank_4 46-96 aa PF12796 Ank_2 108-174 aa PF13637 Ank_4 114-164 aa PF13606 Ank_3 144-167 aa PF00023 Ank 144-174 aa PF13962 PGG 212-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775995.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	10	98	1.2e-23	84.2	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057775995.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	46	96	4.5e-15	56.1	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057775995.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	108	174	1.2e-23	84.2	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057775995.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	114	164	4.5e-15	56.1	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057775995.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	144	167	3.9e-16	58.0	Ankyrin repeat
`XP_057775995.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	144	174	1.3e-17	63.6	Ankyrin repeat
`XP_057775995.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	212	324	7.2e-27	94.2	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920012.1
ATATTAAAATCACTCCACCAATTAACCCTTCCCATGCAAGCTTTTCACCCTCCAAATTAAATATTCCAAATTAAAAACCTCTAGTGTGTGTTGTGTGTGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCATCGATCTGCAGAGAGATGGAATCATCATCAGCTGAGAAGAAGCTCTGCGACGCAGCAGCAGAAGGCGACGCCAAAACGTTCAAACAACTGATCGAAGGAGATCGATTTCTCCTCAACAAAGTCTCACTAACATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994892
ATGGAATCATCATCAGCTGAGAAGAAGCTCTGCGACGCAGCAGCAGAAGGCGACGCCAAAACGTTCAAACAACTGATCGAAGGAGATCGATTTCTCCTCAACAAAGTCTCACTAACATACACCGGCAAAACTTTCTTACACGTCGCAGCAGCTCAGGACTGCGTCGACATCGCCGCCGTGCTGGTGGACGAAGCCCCCAAGATGTGCTGGGCACGCGACGCCGGCGGCATGAACCCCGTCCACGTGGCGGCCATGAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775995.1
MESSSAEKKLCDAAAEGDAKTFKQLIEGDRFLLNKVSLTYTGKTFLHVAAAQDCVDIAAVLVDEAPKMCWARDAGGMNPVHVAAMNGSHGVLRMLVERDDFAAMERLERGETALHLCVKHRQLGALRVLVEKLGEFVCEEDDAGNTVLHWAVRLRQLEIIEYLVALNKLDTNSKNSKGQTPLQMVNPDSDKETAQRIADILKSPAHPTLAEDWLLKKRDSIMVVAILIATMAFQAAVSPTGGVWQDDTSSHKAGEAVMAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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