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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G004348

染色体: Chr07 坐标: 56019150-56022463 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G004348
名称SmilChr07G004348
描述uncharacterized SmilChr07G004348
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向56019150 - 56022463 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130994913
GeneID130994913
locus_tag-
NCBI NameLOC130994913
原始查询SmilChr07G004348

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述rhomboid family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831054]; symbol=AT5G11810; hit=AT5G11810; species=arabidopsis; confidence=high
产物rhomboid family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831054]; symbol=AT5G11810; hit=AT5G11810; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT5G11810 (AT5G11810)
rhomboid family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831054]
identity=47.8; qcov=1; evalue=3.87e-96; confidence=high
RiceOs02g0135600
-
identity=41.6; qcov=1.08; evalue=6.26e-75; confidence=medium
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130994913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 0.60000 XP_057776030.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.60000 XP_057776030.1
3 Cytosol 细胞质基质 0.20000 XP_057776030.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057776030.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057776030.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:56019407 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B132
Chr7:56020527 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A13,C3,C64,C66
Chr7:56020846 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A25,C47,C7,C79,C86
Chr7:56020923 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A7,B92,C71
Chr7:56021054 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B134,B95
Chr7:56021108 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B140,B74,C34,C59,C82
Chr7:56021241 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D4
Chr7:56021268 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B122,B131,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057920047.1
GAAAATATTCTTCATCCCTAAAAGAAAATTAGGAAATATTCCCAAAACCAGCCCTCGTTAACTTTATGCAATCTCTTCTTACACAGTTACACTTGTATACAACATACAAGCATATACATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCAGACAAGCCGAGCAGAGCTCTCGTATTGTACGGTGACGGGCTGGCCCGATTCCTCAGCCCGGCCCAAACTCACCTCAATTCTCTCGCTTCTCGGGCTCTCTGCGGTTTCCTCGC...
XM_057920048.1
GAAAATATTCTTCATCCCTAAAAGAAAATTAGGAAATATTCCCAAAACCAGCCCTCGTTAACTTTATGCAATCTCTTCTTACACAGTTACACTTGTATACAACATACAAGCATATACATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCAGACAAGCCGAGCAGAGCTCTCGTATTGTACGGTGACGGGCTGGCCCGATTCCTCAGCCCGGCCCAAACTCACCTCAATTCTCTCGCTTCTCGGGCTCTCTGCGGTTTCCTCGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC130994913
ATGGCAGACAAGCCGAGCAGAGCTCTCGTATTGTACGGTGACGGGCTGGCCCGATTCCTCAGCCCGGCCCAAACTCACCTCAATTCTCTCGCTTCTCGGGCTCTCTGCGGTTTCCTCGCTCTCCCTCATTCTCCTCAATCAGGGAATTACATTGCAGAAAATGAGGATATGAGGATAGTTAGGGAGTTTGCAGAGTTGCTTGATGCGAACGAAGCATATGAAAGCTCGGTCGCAACAGGAATACGTGAGAATACACCTCA...
LOC130994913
ATGGCAGACAAGCCGAGCAGAGCTCTCGTATTGTACGGTGACGGGCTGGCCCGATTCCTCAGCCCGGCCCAAACTCACCTCAATTCTCTCGCTTCTCGGGCTCTCTGCGGTTTCCTCGCTCTCCCTCATTCTCCTCAATCAGAAAATGAGGATATGAGGATAGTTAGGGAGTTTGCAGAGTTGCTTGATGCGAACGAAGCATATGAAAGCTCGGTCGCAACAGGAATACGTGAGAATACACCTCAAGAAAAGTGTGCATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057776030.1
MADKPSRALVLYGDGLARFLSPAQTHLNSLASRALCGFLALPHSPQSGNYIAENEDMRIVREFAELLDANEAYESSVATGIRENTPQEKCAFPSVAERFMGMKAAIVTDNLSVKSFGGMMVGFKVFSWNKMSENDGSSAESSHLASELLKLLGFQEGQILDSSIYELVFVHIGANTKMNGVAGVDLVNCLVGDLLHKASSESYIGSRLHTSVIMSYGATLGDDDLHLSISNATSEDDGELSRLIPRQSYMMKAGKPRENI...
XP_057776031.1
MADKPSRALVLYGDGLARFLSPAQTHLNSLASRALCGFLALPHSPQSENEDMRIVREFAELLDANEAYESSVATGIRENTPQEKCAFPSVAERFMGMKAAIVTDNLSVKSFGGMMVGFKVFSWNKMSENDGSSAESSHLASELLKLLGFQEGQILDSSIYELVFVHIGANTKMNGVAGVDLVNCLVGDLLHKASSESYIGSRLHTSVIMSYGATLGDDDLHLSISNATSEDDGELSRLIPRQSYMMKAGKPRENIRQHCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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