当前解析结果
SmilChr07G004356| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004356 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004356 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004356 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 56118030 - 56119093 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994969 |
|---|---|
| GeneID | 130994969 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994969 |
| 原始查询 | SmilChr07G004356 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994969 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057776169.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057776169.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776169.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776169.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776169.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:56118046 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C79 |
Chr7:56118055 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C79 |
Chr7:56118084 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B95,B96,C34,C67 |
Chr7:56118106 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,C21 |
Chr7:56118128 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B109,B72,C45 |
Chr7:56118129 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B38,B39 |
Chr7:56118130 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B105,B33,B66 |
Chr7:56118132 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C34,C63 |
Chr7:56118286 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B34,C68 |
Chr7:56118294 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr7:56118313 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 20 | A9,B108,B111,B122,B129,B14,B34,B41,B66,B68,B69,B94,C10,C29,C44,C6,C63,C73,C84,D10 |
Chr7:56118327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B34,B7,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。