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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004361`

染色体: Chr07 坐标: 56161045-56162504 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004361`
名称	SmilChr07G004361
描述	putative F-box protein At5g52610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56161045 - 56162504 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994447`
GeneID	`130994447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994447`
原始查询	`SmilChr07G004361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At5g52610
产物	putative F-box protein At5g52610
Arabidopsis	`AT2G16810` (AT2G16810) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816182] identity=27; qcov=0.625; evalue=1.28e-08; confidence=low
Rice	`Os12g0164300` (OsFbox646) - identity=24.3; qcov=0.746; evalue=5.08e-11; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775472.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775472.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775472.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775472.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56161093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B98
`Chr7:56161122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:56161507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B72,C14
`Chr7:56161514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B21,B65,C30,C38,C69
`Chr7:56161514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B65,C30,C38,C69
`Chr7:56161559`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A15,A16,A25,B15,B24,B32,B36,B38,B39,B51,B52,B87,B9,C16,C22,C26,C35,C4,C49,C63,C66,C75,D4
`Chr7:56161563`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A15,A16,A25,B15,B24,B32,B36,B38,B39,B51,B52,B87,B9,C16,C22,C26,C35,C4,C49,C63,C66,C75,D4
`Chr7:56161568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr7:56161593`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A22,B10,B118,B27,B61,B62,B76,B88,C17,C32,C68
`Chr7:56161597`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A22,B10,B118,B27,B61,B62,B76,B88,C17,C32,C68
`Chr7:56161599`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A22,B10,B118,B27,B61,B62,B76,B88,C17,C30,C32,C68
`Chr7:56161606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775472.1

397 aa

198

397

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 37-77 aa PF12937 F-box-like 39-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775472.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	37	77	7.2e-08	32.7	F-box domain
`XP_057775472.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	39	75	2e-06	28.1	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919489.1
TACACCGGAAATAGAGAAGCTCAAATGCCTCGTAAGAAACCAGTCTTCCGCAAGCCGCCGCCGCGCCGCTGCTGCACCGACGGCAGCGTTTCGGATCCTCATTCGAACATTCTTAGTAGAGAATCGATAAACATAGAGTCCTTCCCCACAGACCTATTGTTCGAAATCCTCCTCCGTTTGCCGGCCGATCATCTCTACGAGAGAGCGAGGCTCGTGTGCCGGCGGTGGTACCACATTATCCATTCTCATGCCTTCATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994447
ATGCCTCGTAAGAAACCAGTCTTCCGCAAGCCGCCGCCGCGCCGCTGCTGCACCGACGGCAGCGTTTCGGATCCTCATTCGAACATTCTTAGTAGAGAATCGATAAACATAGAGTCCTTCCCCACAGACCTATTGTTCGAAATCCTCCTCCGTTTGCCGGCCGATCATCTCTACGAGAGAGCGAGGCTCGTGTGCCGGCGGTGGTACCACATTATCCATTCTCATGCCTTCATCAACGCGCAGATGCACGGTGCTACCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775472.1
MPRKKPVFRKPPPRRCCTDGSVSDPHSNILSRESINIESFPTDLLFEILLRLPADHLYERARLVCRRWYHIIHSHAFINAQMHGATYGLLLSPLNWSNTLPLYVTADADGGIHTSDLNHISKLEVLATSCNGLALEFDFKDRLLRLVNPAKKQSLLLPRLTRGATYAWPTYGFAYSAASLAYKVIARYTVCHSPQRLQTDYGLDVLTVGVNESWRHVEVPHHLSPFFFNEAPLTTEGFMHWGRGRYCVTLDVETEIITLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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