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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004384`

染色体: Chr07 坐标: 56379737-56380754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004384`
名称	SmilChr07G004384
描述	uncharacterized SmilChr07G004384
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56379737 - 56380754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994964`
GeneID	`130994964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994964`
原始查询	`SmilChr07G004384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717702]; symbol=AT2G06265; hit=AT2G06265; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717702]; symbol=AT2G06265; hit=AT2G06265; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G06265` (AT2G06265) zinc ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717702] identity=28.9; qcov=0.703; evalue=1.67e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057776164.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057776164.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057776164.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057776164.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56380129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B113,B117
`Chr7:56380130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:56380163`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A16,B102,B114,B33,B49,B98,C15,C32,C36,C43,C68,C73
`Chr7:56380166`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A16,B102,B114,B33,B49,B98,C15,C32,C36,C43,C68,C73
`Chr7:56380207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:56380221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:56380250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B15
`Chr7:56380349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:56380371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:56380400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,C15,C36,C68,C73
`Chr7:56380409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C46
`Chr7:56380409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776164.1

128 aa

128

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 16-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776164.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	16	55	2.1e-12	47.7	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920181.1
TAAATGCATGTAATATCACGAACTTATGCCGAAATCCATATTTAGCACGAACTTCAAAAGTTCCAATTTATATGGCTAACTATACCCCGTGTCCAATTTTAATACCGTTTTTTTCTCCCCCCAAATTGAATCCTACGTGTCAATGACGTGTCTTGCCGGCACAAGCTTTACTATTTTCCGGCCGGTAATCAAAACGCATCGTTTTTAATAATAAAAAACGATGTCGTTTTCAATAAAGTCTGAATCAATTAAAATTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994964
ATGTCATCTACTTCGTCGTTCTCGTCATATGGTAGCCATGTGGGAGTTACCTGCATTTGCAAGAAGCCCGCAAAGGTCGAAACTTCAAGAACCTCCAAAAATCCGGGACGACTCTTTTATGGTTGTCGATATCGCGAGTGCAATTTTTTCCAATGGGTTGATGAAGGTTGTGGGTATATGGAGAATTGCTCACAAGAGATGAACATTTGGATTGGAGAAAATCTAAGACTTCGTAGACAGCTTGACCAACTTTCACAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776164.1
MSSTSSFSSYGSHVGVTCICKKPAKVETSRTSKNPGRLFYGCRYRECNFFQWVDEGCGYMENCSQEMNIWIGENLRLRRQLDQLSQRIHDLEAMNVGLKVKNSMIKRQAARLRLGCICLAIWLIYVLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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