当前解析结果
SmilChr07G004385| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004385 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004385 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004385 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 56380831 - 56381750 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994951 |
|---|---|
| GeneID | 130994951 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994951 |
| 原始查询 | SmilChr07G004385 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G06740 (MUG3)MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=32.3; qcov=0.493; evalue=1.9e-08; confidence=low |
| Rice | Os09g0268600- identity=43.3; qcov=0.483; evalue=1.46e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994951 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057776145.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776145.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776145.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776145.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057776145.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:56381011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B80,C38,C60 |
Chr7:56381011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B80,C38,C60 |
Chr7:56381023 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B128 |
Chr7:56381025 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,B77 |
Chr7:56381026 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,B24,B79,C17,C30 |
Chr7:56381033 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:56381034 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr7:56381049 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C17 |
Chr7:56381067 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B10,B113,B117,B87 |
Chr7:56381115 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B98,C34,C52 |
Chr7:56381152 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B138,B90,B92,C7,C73 |
Chr7:56381152 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B138,B90,B92,C7,C73 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。