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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004391`

染色体: Chr07 坐标: 56496055-56498346 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004391`
名称	SmilChr07G004391
描述	uncharacterized SmilChr07G004391
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56496055 - 56498346 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994454`
GeneID	`130994454`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994454`
原始查询	`SmilChr07G004391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=38.9; qcov=0.103; evalue=1.87e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994454

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775478.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775478.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057775478.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775478.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057775478.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56496081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C6,D10
`Chr7:56496082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:56496091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A22,B100,B118,B12,B120,B124,B13,B139,B14,B140,B19,B28,B30,B42,B44,B54,B59,B6,B61,B71,B74,B75,B8,B82,C1,C12,C15,C27,C38,C4,C42,C47,C5,C56,C57,C61,C67,C82,C84,C86,D9
`Chr7:56496097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A9,C1,C44,C6,D8
`Chr7:56496097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C1,C44,C6,D8
`Chr7:56496109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C34
`Chr7:56496115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A6,B1,B100,B104,B117,B119,B120,B124,B126,B135,B28,B30,B33,B47,B50,B56,B58,B64,B67,B69,B73,B79,B8,B83,B85,B91,B96,C15,C17,C19,C40,C52,C55,C59,C62,C7,C77
`Chr7:56496122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B58,B59
`Chr7:56496139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B17,B23,B25,B62,B70,B78,B98,C14,C2,C35,C40,C49,C5,C63,C68,C9
`Chr7:56496181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A18,A25,B107,B5,B67,C14,C71
`Chr7:56496218`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A15,B9
`Chr7:56496218`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A15,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919495.1
ATGGCTACTGCGGAAGAAGTCCGTGCCCTGAGAGAGCAGTTGCAGGCGTTGATGGATGCTCAGAAAACTGTTGCTGAGCAGAGACAGCCGCCTATTGATGAGGCATTTACTCCACTGTACCAGTACCAGGAGCCGCCTAGAGTCAACGCAAATAATTTCGAGCTAAGGGCTGGGTTGATCACCATGGTACAACAGAAACAATACGGAGGTAGTGCCGCAGAGGATCCCAACGTGCACTTGAGGCAGTTTCTGGAGTTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994454
ATGGCTACTGCGGAAGAAGTCCGTGCCCTGAGAGAGCAGTTGCAGGCGTTGATGGATGCTCAGAAAACTGTTGCTGAGCAGAGACAGCCGCCTATTGATGAGGCATTTACTCCACTGTACCAGTACCAGGAGCCGCCTAGAGTCAACGCAAATAATTTCGAGCTAAGGGCTGGGTTGATCACCATGGTACAACAGAAACAATACGGAGGTAGTGCCGCAGAGGATCCCAACGTGCACTTGAGGCAGTTTCTGGAGTTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775478.1
MATAEEVRALREQLQALMDAQKTVAEQRQPPIDEAFTPLYQYQEPPRVNANNFELRAGLITMVQQKQYGGSAAEDPNVHLRQFLELCSTIKMNGVADDIIRLRLFPFSLQDKAKSWYHTLQLGANPAWEEVAHLFLRKFHPPGLTLKLKMDIVQFQQFEGESLAETWERYQEKLRKCPSHGFDEGTLVVMFYNACGERTRMFMDTAAGGSLLKKGSAEAMEIIESMAATSYQWPSERVQLKKVDAASSSDPLALISTQLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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