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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004392`

染色体: Chr07 坐标: 56513233-56516082 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004392`
名称	SmilChr07G004392
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56513233 - 56516082 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994455`
GeneID	`130994455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994455`
原始查询	`SmilChr07G004392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=25.4; qcov=0.979; evalue=6.48e-64; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.9; qcov=0.518; evalue=4.11e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775481.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775481.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775481.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775481.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56513254`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B101,B6,C25,C28,C38,C41,C46,C52,C70,C86,D7
`Chr7:56513290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B137,B34,C24,C70
`Chr7:56513294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B37
`Chr7:56513298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B27,B37,C40
`Chr7:56513321`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B25
`Chr7:56513321`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B25
`Chr7:56513347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:56513362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,C55,C68,C69
`Chr7:56513381`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C37
`Chr7:56513381`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C37
`Chr7:56513385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B100,B99,C58,D3
`Chr7:56513386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B82,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775481.1

949 aa

474

949

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 174-348 aa PF23559 WHD_DRP 434-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775481.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	174	348	9.8e-38	130.1	NB-ARC domain
`XP_057775481.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	434	506	4.8e-16	59.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919498.1
ATGGCAGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAAGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGGATCAAATTCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994455
ATGGCAGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAAGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGGATCAAATTCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775481.1
MAAYGALVSLMHIIDRLEKHPSPPISIHKQQVESLTQNVTFLQDFLDAYISPVVDDHEADPLERRIADAVYAAEDVIESQIVDQIHNRSTICGKMSSFINLFRALCNCATIEEDFYHDLQHVIEEMNLIKKEAMEIAAAAQLQTKVSSTRAGSSTFSSTVQEMIIMVGFDKVLLEVLDKLTGGQLSRQIIPIMGMGGIGKTTLARHVFQHALVKEHFDICVWTTISQTYNVRETLREVLFQASGDPHCDQLSENQLGQKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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