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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004395`

染色体: Chr07 坐标: 56560366-56561902 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004395`
名称	SmilChr07G004395
描述	uncharacterized SmilChr07G004395
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56560366 - 56561902 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994896`
GeneID	`130994896`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994896`
原始查询	`SmilChr07G004395`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0447600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0447600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0447600` - identity=27.5; qcov=0.508; evalue=3.79e-08; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994896

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776000.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776000.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057776000.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776000.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776000.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56560488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A24,B104,B3,B34
`Chr7:56560488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B104,B3,B34
`Chr7:56560493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:56560522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C39,C4
`Chr7:56560566`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A13,B21,B28,B34,B38,B61,B90,C57,C79,D3
`Chr7:56560575`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A13,B21,B28,B34,B38,B39,B61,B90,C57,C79,D3
`Chr7:56560663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:56560683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C60
`Chr7:56560692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:56560696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:56560743`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C27
`Chr7:56560743`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776000.1

372 aa

186

372

F-box-like

F-box

FBA_3

PF12937 F-box-like 12-50 aa PF00646 F-box 12-52 aa PF08268 FBA_3 101-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776000.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	12	50	1.4e-06	28.7	F-box-like
`XP_057776000.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	12	52	0.00019	21.9	F-box domain
`XP_057776000.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	101	220	2.8e-08	33.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920017.1
TCACCGGAAATAGAAAAGCTGAAATGCTTCGTACGAAACCAGTCTTCCACAAGAAGCTGCCTCTGCGCCGCTGCCAGCGATTCGGATCCCCATTCCGACATTCTTAGTAGAGAATCCATGATATACGTTGGAAAGGAGAGGTCAACAAGCATAGAGTCCCTCCCCAAAGAGCTATTGTTTGAAATTCTCCTACGTCTGCCCGCCGATCATCTCTACGAGAGTGCGAGGCTCGTGTGCCGGTGGTGGTGCCACATTATCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994896
ATGATATACGTTGGAAAGGAGAGGTCAACAAGCATAGAGTCCCTCCCCAAAGAGCTATTGTTTGAAATTCTCCTACGTCTGCCCGCCGATCATCTCTACGAGAGTGCGAGGCTCGTGTGCCGGTGGTGGTGCCACATTATCCATTCTCATGCCTTCATCAACGCGCAGATACACGGTGCTACCTATGGACTCCTTATATGCCCCCTAAAGTTTTATACTCTGCCACTTCATCCACTTTATGTAACAGCCGACGCAGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776000.1
MIYVGKERSTSIESLPKELLFEILLRLPADHLYESARLVCRWWCHIIHSHAFINAQIHGATYGLLICPLKFYTLPLHPLYVTADADGGIHSSELNHFSKWGVLATCNGLVLYAKDYWLLRLVNPATKQSFLLPALPRHLSYGRFEYDFAYSAASSAYKVIQQYTTCQSPPRLPADTSGLDVLTVGVDESWRHVEVHHLPDHVRSFFFFKAPLTSEGFLHWGEGRYCATMDVEKEIITLSEAPYQYDESDYYYLSTGRCLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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