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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004397`

染色体: Chr07 坐标: 56605268-56607491 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004397`
名称	SmilChr07G004397
描述	uncharacterized SmilChr07G004397
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56605268 - 56607491 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994895`
GeneID	`130994895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994895`
原始查询	`SmilChr07G004397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869]; symbol=CPR1; hit=AT4G12560; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869]; symbol=CPR1; hit=AT4G12560; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=31.6; qcov=0.413; evalue=3.45e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775999.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775999.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775999.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775999.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56605425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C56
`Chr7:56605432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C50
`Chr7:56605471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B89,B95,C48,C50
`Chr7:56605507`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B22,C72,C9
`Chr7:56605507`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B22,C72,C9
`Chr7:56605635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B60,C39
`Chr7:56605654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B16,C75
`Chr7:56605681`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B134
`Chr7:56605681`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B134
`Chr7:56605683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B22,C15,C20
`Chr7:56605689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:56605716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B120,B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775999.1

375 aa

188

375

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 22-60 aa PF00646 F-box 22-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775999.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	22	60	2.2e-06	28.1	F-box-like
`XP_057775999.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	22	62	5e-06	26.9	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920016.1
GTTGAGCAGAGATGGTGTTGAGATGGTGTCGAGCGGCCTTTTGTTTCGTTTGAATGTATATAGCGAGACGCATGTCTTGAACATGCCTCTCAACACAAATTATATAATTGTTGTTGTGTTTATACAAGTTTTTGTAAATTCTTCTTGTTCTAATGCAATGCAACCTAATTAGAGGTGTTCTACTAGTTAAAAGTATTTGCTTCTCATGTTAATTTGTTTGATTGAGTCAAAAGAATTTGAAAAACTTTGTGATTGAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994895
ATGATACACATTAGAAGTCGGGCTTATTATTTCCGGAGGTGTAAAAAGGAGAGGCCAACAAACATAGACTCCCTCCCCACAGACCTATTGTTTGAAATCCTCCTCCGTCTCCCGGCCGATCATCTCTACGAGACTGCGATGCACGTCTGCCAGCGGTGGTACCACATGATCCATTCTCATGCCTTCATCAACTCGCAGATGCACGGTTCTACCTATGGACTCCTCCTATCACCCATAAAGGCTAAAGCTCTGCCACTTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775999.1
MIHIRSRAYYFRRCKKERPTNIDSLPTDLLFEILLRLPADHLYETAMHVCQRWYHMIHSHAFINSQMHGSTYGLLLSPIKAKALPLYVTADADGGIHTSELNHIPRLGVLATCNGLVLELDDKRYPRLANPATKQSFLLPPYPKGCMYYQFYCGLACSAASLAYKVIAPSPVYHSAPLRQIDHGLVVLTVGVDESWRNVEVHHLPDHVRRFFFDKAPLTSEGFLHWGRGRYCATMDVEMKVITLSEAPYQYHESNYYYLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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