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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004398`

染色体: Chr07 坐标: 56627838-56630126 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004398`
名称	SmilChr07G004398
描述	uncharacterized SmilChr07G004398
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56627838 - 56630126 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994871`
GeneID	`130994871`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994871`
原始查询	`SmilChr07G004398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox482; symbol=OsFbox482; hit=Os09g0372900; species=rice; confidence=low
产物	OsFbox482; symbol=OsFbox482; hit=Os09g0372900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0372900` (OsFbox482) - identity=26.4; qcov=0.425; evalue=5.25e-06; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994871

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775964.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775964.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775964.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775964.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56628625`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B88
`Chr7:56628625`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B88
`Chr7:56628641`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	106	A1,A10,A13,A20,A21,A23,A24,A25,A5,B1,B102,B103,B105,B11,B111,B112,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B125,B128,B129,B136,B137,B15,B16,B17,B21,B25,B26,B3,B31,B32,B34,B36,B4,B40,B41,B45,B46,B54,B57,B60,B67,B68,B69,B72,B8,B80,B87,B88,B9,B90,B91,B93,B94,B95,B97,C1,C10,C12,C14,C18,C21,C24,C26,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C52,C56,C6,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C71,C73,C75,C76,C77,C8,C83,C86,C87,D1,D10,D11,D6,D7,D8
`Chr7:56628644`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	107	A1,A10,A13,A20,A21,A23,A24,A25,A5,B1,B102,B103,B105,B11,B111,B112,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B125,B128,B129,B136,B137,B15,B16,B17,B21,B25,B26,B3,B31,B32,B34,B36,B4,B40,B41,B45,B46,B54,B57,B60,B67,B68,B69,B72,B8,B80,B87,B88,B9,B90,B91,B93,B94,B95,B97,C1,C10,C12,C14,C18,C21,C24,C26,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C39,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C52,C56,C6,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C71,C73,C75,C76,C77,C8,C83,C86,C87,D1,D10,D11,D6,D7,D8
`Chr7:56628671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:56628736`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A6,B128,B22,B69,B91,C1,C21,C76,C9,D1
`Chr7:56628746`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A6,B128,B22,B69,B91,C1,C21,C76,C9,D1
`Chr7:56628951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr7:56629046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C57
`Chr7:56629115`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B47,C16,C53,C73,C8,D2,D9
`Chr7:56629116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:56629130`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	83	A13,A21,A24,A5,B10,B102,B103,B104,B111,B112,B12,B123,B129,B137,B138,B15,B16,B17,B26,B28,B34,B40,B41,B44,B45,B46,B49,B54,B56,B60,B65,B67,B68,B69,B72,B87,B88,B9,B90,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C21,C23,C24,C3,C30,C31,C35,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C52,C56,C57,C68,C69,C70,C71,C73,C77,C8,C82,C83,C85,C87,D11,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775964.1

445 aa

222

445

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 81-119 aa PF00646 F-box 81-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775964.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	81	119	2.8e-07	30.9	F-box-like
`XP_057775964.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	81	121	4e-08	33.5	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919981.1
TATCTAATTAGAATAGAATGGGCCATGTTTTGGGTTTTAGGTTTATTTCGGTTAGGGCGGGAAACTGCTGTATTTATTTAGGTTCTCCGCCGCGGCATTCTACACACTTCACTGGAAATAGAAAAGCTGAAATGCTCCGTACGAAACCAGTCCTCCGCAAGCCGCCGCCTCCGTTGGTGCGCCGCTGCTGCACCGACGGCAGCGTTTCGGATCCCCATTCCGACATTCTTAGTAGACAATCGGAGAGGCCAACAAACATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994871
ATGGGCCATGTTTTGGGTTTTAGGTTTATTTCGGTTAGGGCGGGAAACTGCTGTATTTATTTAGGTTCTCCGCCGCGGCATTCTACACACTTCACTGGAAATAGAAAAGCTGAAATGCTCCGTACGAAACCAGTCCTCCGCAAGCCGCCGCCTCCGTTGGTGCGCCGCTGCTGCACCGACGGCAGCGTTTCGGATCCCCATTCCGACATTCTTAGTAGACAATCGGAGAGGCCAACAAACATAGAGTCCCTCCCCACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775964.1
MGHVLGFRFISVRAGNCCIYLGSPPRHSTHFTGNRKAEMLRTKPVLRKPPPPLVRRCCTDGSVSDPHSDILSRQSERPTNIESLPTDLLFEILLLLPADHLYMRARLVCRRWCHIIRSHAFINAHMHSATYGLLLWPLTDNTLPLYVTADADGGIHTSELNHISELGVLFNCDGFALEMALGDYYRLQLANPATKQLFRQPRPREGLRYIMALCGLAYSAASLAHKVIVPYTVRHSPPRLQTDYGLDVFTVGVDESWRHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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