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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004432`

染色体: Chr07 坐标: 56997271-57000355 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004432`
名称	SmilChr07G004432
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56997271 - 57000355 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994799`
GeneID	`130994799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994799`
原始查询	`SmilChr07G004432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.3; qcov=0.958; evalue=3.02e-65; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.4; qcov=0.769; evalue=1.78e-70; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775843.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775843.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775843.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775843.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56997402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B64,B80,C46,C71
`Chr7:56997424`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr7:56997424`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr7:56997454`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr7:56997454`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr7:56997457`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr7:56997457`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr7:56997461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A11,A23,B101,B109,B110,B112,B127,B15,B21,B34,B4,B44,B46,B57,B64,B71,B78,B80,B82,B85,B89,B96,C13,C33,C38,C42,C46,C49,C5,C64,C71,D3,D4
`Chr7:56997505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C80
`Chr7:56997516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr7:56997590`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr7:56997590`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775843.1

957 aa

478

957

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 204-366 aa PF23559 WHD_DRP 452-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775843.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	204	366	5.1e-39	134.3	NB-ARC domain
`XP_057775843.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	452	524	7.2e-16	58.7	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919860.1
GTTGTGGAATCATAATATAACCAGATTGCTTGCCTTCTTCACCTCTCAAATACTATCTCATATATATATATATTTTCATTCACACTTCCCATAAATATATACATTATTAACTCAAAGAGTTAATCATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994799
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAAGCAGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATTGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775843.1
MAAYGALVSLMHIIDRLEKHPSPPISIHKQQVESLTQNVTFLQDFLDAYISPVVDDHEADPLERRIADAVYAAEDVIESQIVLQIHNRSTIRGKMSSFINRFRARCKCETIDRNELEVGVNAAEDFYHDLQQVIEEMNSISTAADQLQRKVSSTHAASSSTVIKKDVMEIVAAAQLPRKVSSTHAASSSYVKESMMVGFKEVLLEVLDKLTGGQRSRQIIPIMGMGGIGKTTLARHLFEHALVKEHFDICSWTTISQTYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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