当前解析结果
SmilChr07G004444| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004444 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004444 |
| 描述 | leucine-rich repeat extensin-like protein 3 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 57079518 - 57080087 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994469 |
|---|---|
| GeneID | 130994469 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994469 |
| 原始查询 | SmilChr07G004444 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | leucine-rich repeat extensin-like protein 3 |
| 产物 | leucine-rich repeat extensin-like protein 3 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994469 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057775495.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775495.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775495.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775495.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775495.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:57079556 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B40 |
Chr7:57079770 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B46,D7 |
Chr7:57079866 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B97 |
Chr7:57079903 |
CTA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 26 | A25,B117,B119,B120,B132,B140,B19,B46,B52,B55,B57,B58,B73,B87,C1,C20,C22,C29,C48,C5,C54,C66,C69,C78,C84,D4 |
Chr7:57080039 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B86 |
Chr7:57080039 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。