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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004446`

染色体: Chr07 坐标: 57088848-57089396 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004446`
名称	SmilChr07G004446
描述	uncharacterized SmilChr07G004446
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57088848 - 57089396 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994470`
GeneID	`130994470`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994470`
原始查询	`SmilChr07G004446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=36.1; qcov=0.436; evalue=2.7e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=33.3; qcov=0.455; evalue=1.21e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994470

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775496.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775496.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775496.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775496.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775496.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57088876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:57088877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:57088884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B134
`Chr7:57088939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B47
`Chr7:57088965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B26
`Chr7:57088990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B28,B38,C21,C86
`Chr7:57088993`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B61,C19
`Chr7:57088993`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B61,C19
`Chr7:57088996`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B65,B67,B71,C31,C71
`Chr7:57088996`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B65,B67,B71,C31,C71
`Chr7:57089000`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B65,B67,B71,C31,C71
`Chr7:57089000`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B65,B67,B71,C31,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775496.1

165 aa

165

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 11-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775496.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	11	83	5.2e-17	63.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919513.1
ATGACAGCAACCGCAAATCACAGTTACAGCGAGAAACTGGAATTCACTATGATCTGGAAAACACCTGCGACGCAGAAGGCAAAAACTACTGCATGGAGAGTACTCAAAGGGAGGATGGCAACTTGTGATAATCTCCAGCGCCGACAGGTGAACGTCTCAAGCTCGGAAGCAGTTTGTGTTTTATGTAAGACGCATTTGGAAACCACAGAACACCTGTTCTTTACTTGCCAAAATTCTGTTGATATTTGGAACGATGTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994470
ATGACAGCAACCGCAAATCACAGTTACAGCGAGAAACTGGAATTCACTATGATCTGGAAAACACCTGCGACGCAGAAGGCAAAAACTACTGCATGGAGAGTACTCAAAGGGAGGATGGCAACTTGTGATAATCTCCAGCGCCGACAGGTGAACGTCTCAAGCTCGGAAGCAGTTTGTGTTTTATGTAAGACGCATTTGGAAACCACAGAACACCTGTTCTTTACTTGCCAAAATTCTGTTGATATTTGGAACGATGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775496.1
MTATANHSYSEKLEFTMIWKTPATQKAKTTAWRVLKGRMATCDNLQRRQVNVSSSEAVCVLCKTHLETTEHLFFTCQNSVDIWNDVLNWLGKKAVLHHKAKDHFLAFRSIEDKEEEKNEGKFNQGVWNKDRIVTEIKSRLWGWNEAFNLTNAAPDFRSWFINAES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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