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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004460`

染色体: Chr07 坐标: 57191371-57194119 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004460`
名称	SmilChr07G004460
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57191371 - 57194119 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994477`
GeneID	`130994477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994477`
原始查询	`SmilChr07G004460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=24.1; qcov=1.04; evalue=4.28e-51; confidence=weak
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.6; qcov=0.802; evalue=4.33e-54; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057775502.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775502.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775502.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775502.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57191398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B55,B71,C62,D9
`Chr7:57191427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B71,C48
`Chr7:57191442`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C69
`Chr7:57191442`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C69
`Chr7:57191445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B71,C48,C8
`Chr7:57191486`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A8
`Chr7:57191486`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A8
`Chr7:57191522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B51,C63,C65
`Chr7:57191601`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B10,B12,B35,B40,B45,B60,B66,B68,C16,C20,C58,C59,C84,C87
`Chr7:57191604`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	B10,B12,B35,B40,B45,B60,B66,B68,C16,C20,C58,C59,C84,C87
`Chr7:57191609`	`T`	`TC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	14	B10,B12,B35,B40,B45,B60,B66,B68,C16,C20,C58,C59,C84,C87
`Chr7:57191618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775502.1

870 aa

435

870

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 185-346 aa PF23559 WHD_DRP 390-457 aa PF23598 LRR_14 506-717 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775502.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	185	346	1.3e-39	136.2	NB-ARC domain
`XP_057775502.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	390	457	1.5e-14	54.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057775502.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	506	717	5.8e-16	58.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919519.1
ATGGCGGCTTATGCAGCTCTGGTTTCCCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAATCATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCGATAAAGAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAAGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTACGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994477
ATGGCGGCTTATGCAGCTCTGGTTTCCCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAATCATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCGATAAAGAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAAGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTACGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775502.1
MAAYAALVSLMHIIDRLENHPSPPISIDKEQVESLTQIVTFLQDFLDAYISPVVDDHEADPLERRIADAVYAAEDVIESQIVLQIHNRSTIIGRCPVDNRSTIRRKMSSFINLFRARCKCSTIEEDFYHDLQQVIEEMNLIKNEAMETAIAVDQLQRKVSSSTHAGSTSTVKESMMLGFDEVFLQVLDRLTGGQRSRQIIPIMGMGGIGKTTLARHVFEHALVKQHFDICAWTTISQTYNVRETLREVLFQASGDSSSDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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