当前解析结果
SmilChr07G004465| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004465 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004465 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004465 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 57237263 - 57237814 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994479 |
|---|---|
| GeneID | 130994479 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994479 |
| 原始查询 | SmilChr07G004465 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G09510 (AT3G09510)Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=27.7; qcov=0.847; evalue=3.89e-09; confidence=low |
| Rice | Os02g0118800- identity=28.2; qcov=0.776; evalue=3.84e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13966 (zf-RVT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994479 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775504.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775504.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775504.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775504.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775504.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775504.1PF13966
zf-RVT 8-76 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775504.1 |
Pfam | PF13966 |
zf-RVT | Domain | 8 | 76 | 5.6e-17 | 62.9 | zinc-binding in reverse transcriptase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。