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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004466`

染色体: Chr07 坐标: 57242948-57243556 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004466`
名称	SmilChr07G004466
描述	uncharacterized SmilChr07G004466
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57242948 - 57243556 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994480`
GeneID	`130994480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994480`
原始查询	`SmilChr07G004466`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=29.4; qcov=0.624; evalue=1.39e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.8; qcov=0.941; evalue=6.33e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775506.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057775506.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775506.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775506.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57242969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B59,C26,C62,C78
`Chr7:57242970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr7:57242978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:57243007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:57243026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr7:57243033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B127,C45
`Chr7:57243041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B127,B51,C45
`Chr7:57243050`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A1,A16,A2,A23,A24,B101,B112,B114,B115,B119,B122,B125,B129,B138,B17,B30,B38,B4,B42,B43,B48,B50,B59,B67,B70,B73,B77,B86,B91,B93,C10,C18,C2,C24,C29,C38,C55,C62,C63,C64,C78,C84,D8
`Chr7:57243078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:57243079`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A6,B110,B124,B24,B36,B5,C34,C5,C58,D7
`Chr7:57243083`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A15,A7,B103,B104,B35,B36,B5,B55,B94,B99,C10,C26,C29,C39,C64,C69,D11
`Chr7:57243134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775506.1

202 aa

101

202

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 17-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775506.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	17	110	5.6e-18	66.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919523.1
ATGGAAAAAAGTGATGGATGGAAGTGGAATGCATCTCCAAACGGCATGTTCTCCATCAAATCGGCTTATACTACTTTGAGTATGACAGCAACCGCAAATCACAGTTACAGCGAGAAACCGGAATTCACTATGATCTGGAAAACACCTGCGACGCAGAAGGCAAAAACTACTGCCTGGAGAGTACTCAAAGGGAGGATGGCAATTTGTGATAATCTCCAGCGCCAACAGGTGAACATCTCAAGCTCGGAAGCAGTTTGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994480
ATGGAAAAAAGTGATGGATGGAAGTGGAATGCATCTCCAAACGGCATGTTCTCCATCAAATCGGCTTATACTACTTTGAGTATGACAGCAACCGCAAATCACAGTTACAGCGAGAAACCGGAATTCACTATGATCTGGAAAACACCTGCGACGCAGAAGGCAAAAACTACTGCCTGGAGAGTACTCAAAGGGAGGATGGCAATTTGTGATAATCTCCAGCGCCAACAGGTGAACATCTCAAGCTCGGAAGCAGTTTGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775506.1
MEKSDGWKWNASPNGMFSIKSAYTTLSMTATANHSYSEKPEFTMIWKTPATQKAKTTAWRVLKGRMAICDNLQRQQVNISSSEAVCVLCKTHLETTEHLFFTCQNSVDIWNDVLNWLGKKTVLHHKAKDHFLAFRSIGDKEEEKFYSGIWICIIWCVWKGRNEGKFNQGVWNKDRIVTEIKSRLWGWKEAFNLTNASPDFRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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