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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004489`

染色体: Chr07 坐标: 57435750-57438623 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004489`
名称	SmilChr07G004489
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57435750 - 57438623 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994484`
GeneID	`130994484`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994484`
原始查询	`SmilChr07G004489`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=24.9; qcov=0.98; evalue=1.07e-66; confidence=weak
Rice	`Os10g0358200` - identity=28.5; qcov=0.83; evalue=6.84e-68; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994484

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775510.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775510.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775510.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775510.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57435755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,C1,C2,C82
`Chr7:57435796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B9,C40,D5
`Chr7:57435815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,D4
`Chr7:57435850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B7,C23,C41,C42
`Chr7:57435878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:57435902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:57435948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C3
`Chr7:57435967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B44,C62,C74
`Chr7:57436027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B97,C45,C55,D8
`Chr7:57436054`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B15,B5,B88,C17,C49
`Chr7:57436054`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B15,B5,B88,C17,C49
`Chr7:57436089`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B7,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775510.1

957 aa

478

957

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 204-367 aa PF23559 WHD_DRP 452-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775510.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	204	367	3.6e-40	138.1	NB-ARC domain
`XP_057775510.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	452	524	5.6e-16	59.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919527.1
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATTCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAACCAGATTCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTACGCAGCTGAGGATGCCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994484
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATTCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAACCAGATTCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTACGCAGCTGAGGATGCCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775510.1
MAAYGALVSLMHIIDRLEKHPSPPISIHKQQVESLTQNVTFLQDFLDSYISPVVDDHEPDSLERRIADAVYAAEDAIESQIVLQIDNRPKIPGKMSSFINLFRARCKCATIDRNELEVGVNAAEDFYHDLQQVIEEMNSISTAADQLQRKVSSTHAASSSTVIKKDVLEIVAAAQLPRKVSSTHAASSSSVKESMMVGFKEVLLEVLDKLTGGQRSRQIIPIMGMGGIGKTTLARHVFEHALVKEHFDICAWTTISQTYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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