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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004500`

染色体: Chr07 坐标: 57667077-57668684 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004500`
名称	SmilChr07G004500
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57667077 - 57668684 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994488`
GeneID	`130994488`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994488`
原始查询	`SmilChr07G004500`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=31.4; qcov=0.959; evalue=1.06e-64; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=33.6; qcov=0.679; evalue=3.06e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994488

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775514.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775514.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775514.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775514.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775514.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57667228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A20,B72,C79,D9
`Chr7:57667231`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B72,D11
`Chr7:57667231`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B72,D11
`Chr7:57667252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A20,C79,D9
`Chr7:57667263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B59,C49
`Chr7:57667275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,C9
`Chr7:57667278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr7:57667290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C13,C51
`Chr7:57667307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B32,B77,C68
`Chr7:57667350`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,B61,C41,C61,C64,D3
`Chr7:57667400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:57667425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775514.1

535 aa

268

535

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 185-346 aa PF23559 WHD_DRP 432-502 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775514.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	185	346	1.1e-38	133.2	NB-ARC domain
`XP_057775514.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	432	502	5.4e-16	59.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919531.1
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGATTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCGGTTGTGGATGACCATGAAGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994488
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGGATTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCGGTTGTGGATGACCATGAAGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775514.1
MAAYGALVSLMHIIDRIEKHPSPPISIHKQQVESLTQNVTFLQDFLDAYISPVVDDHEADPLERRIADAVYAAEDVIESQIVLQIHNQSRIRGKMSSFINLFRARCKCTTIDRNEFELGVNASEEFYHDLQQVIEEMNLIKKEAMEIAAAAQLQTKVSSSHVVSSTSSSSVKESKMVGFVEVLLEVLDKLSGGQLSRQIIPIMGMGGTGKTTLARHVFQHALVKEHFDICAWTTISQTYNLKETLREVLFQASGHSSSDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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